454新测序仪GS Junior的早期试用情况[心得点评]

【字体: 时间:2010年04月22日 来源:生物通

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  去年11月,罗氏454宣布即将推出新的普及型测序平台-GS Junior System。这几个月,一直没有GS Junior的消息。直到最近,一批早期试用者在德国慕尼黑分析技术展上分享了他们使用GS Junior的初步结果。

去年11月,罗氏454宣布即将推出新的普及型测序平台-GS Junior System。这几个月,一直没有GS Junior的消息。直到最近,一批早期试用者在德国慕尼黑分析技术展上分享了他们使用GS Junior的初步结果。

Roger Wiseman博士是美国威斯康星大学威斯康星国家灵长目研究中心的研究人员。他们实验室最近安装了一台GS Junior System。他们利用GS Junior Titanium试剂进行定向扩增子测序,分析了非洲绿猴(生物医学研究中广泛使用的灵长目动物之一)的MHC多样性。利用GS Junior单次运行所产生的数据,研究小组得到了意想不到的低水平MHC多样性。他们的结果将会在晚一些发表,可能对疫苗和艾滋病发病机理研究中绿猴的使用有意义。

Wiseman博士解释到:“GS Junior System最让人激动的一点是入门费用低,能运行小型的试验研究。在高通量DNA测序还未出现之前,我们曾开展过绿猴MHC遗传学研究,我们也一直考虑继续研究下去,但很不经济。既然我们现在得到了有趣的结果,我们就能回去并快速跟进。即便没有结果,我们也没损失什么。”

德国bio.logis公司将是德国第一位购买GS Junior System的客户。该公司计划使用这个平台来揭开糖尿病的遗传起因。

GS Junior System的大小与普通的激光打印机差不多,它的性能和特征会更适合小型-中型实验室的需求。此平台将会与长读长的GS Junior Titanium试剂共同上市,测序平均读长将达到400 bp。测序系统还会带有一台电脑,专为GS Junior的运行和下游数据分析而优化。

根据目前公布的数据,GS Junior System的通量为每次运行产生35 Mb以上的高质量碱基。平均读长为400个碱基,每次运行平均产生10万个读数。400个碱基的准确率为99%。文库制备仅需半天,测序需要10个小时,然后2小时处理数据。测序原理与GS FLX相似。

454生命科学的总裁Christopher McLeod预计GS Junior系统将会像个人电脑在大众中普及一样,在测序实验室中普及。他曾表示:“这项技术是几乎所有实验室都能拥有的。同时,我们仍将继续扩展我们的旗舰平台-GS FLX系统的性能。”

GS Junior System将会在今年上市,具体上市时间暂时未知。如果您对这台测序仪感兴趣,请点击此处留言,罗氏公司的人员将会与您联系。(生物通 余亮)

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