F1000公布7大生物化学论文

【字体: 时间:2010年07月09日 来源:生物通

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  “F1000(Faculty of 1000 Medicine)”又名“千名医学家”,是由美国哈佛大学和英国剑桥大学等全世界2500名国际顶级医学教授组成的国际权威机构。

  

生物通报道:“F1000(Faculty of 1000 Medicine)”又名“千名医学家”,是由美国哈佛大学和英国剑桥大学等全世界2500名国际顶级医学教授组成的国际权威机构。其中最受关注的七篇生物化学论文如下:

1.呼吸链第一种酶结构确定

R.G. Efremov et al. "The architecture of respiratory complex I," Nature, 465(7297):441-5. 2010. Eval by Nathan Nelson, Tel Aviv University; Andrea Mattevi, University of Pavia; Terrence Frey, San Diego State University; Thomas Meier, Max Planck Institute of Biophysics.

Complex I是呼吸链的第一种酶,它通过将NADH和苯醌之间的电子转移同质子转位耦合起来,而在线粒体中的细胞能量生产中扮演一个中心角色。这个巨大的复合物是呼吸链的最后环节,其机制和完整结构过去并不为人们所知。

现在,来自大肠杆菌的Complex I的膜区域以及来自温泉菌(嗜热菌)的完整Complex I的结构已被确定。这些结构提供了关于耦合机制的有力线索:两个主要区域界面上发生的构形变化,会驱动一个长阿尔法螺旋发生一种活塞式运动,使附近跨膜螺旋倾斜,导致质子转位。本期封面图片所描绘的是来自嵌入在类脂双层中的温泉菌(嗜热菌)的呼吸链Complex I。每个亚单元都用不同颜色表示,亲水区域中的Fe-S簇显示为球形。背景所示为偏振光下的膜区域的晶体。


2.异常长寿的大肠杆菌

P. Wang et al. "Robust Growth of Escherichia coli," Curr Biol, 20: 1099-1103. 2010. Eval by Roy Kishony, Harvard University; Thomas Meier, Max Planck Institute of Biophysics.


3.为什么蛋白有“结”?

A.L. Mallam et al. "Experimental detection of knotted conformations in denatured proteins," Natl Acad Sci, 107(18):8189-94. 2010. Eval by Werner Streicher and George Makhatadze, Rensselaer Polytechnic Institute; Aaron Burton and Niles Lehman, Portland State University.


4.自我组装的膜

V. Percec et al. "Self-assembly of Janus dendrimers into uniform dendrimersomes and other complex architectures," Science, 328(5981):1009-14. 2010. Eval by Anthony Czarnik, University of Nevada; Donald Tomalia, Central Michigan University.
 

5.蛋白如何形成回沟
S. Stella et al. "The shape of the DNA minor groove directs binding by the DNA-bending protein Fis," Genes Dev, 24(8):814-26. 2010. Eval by Charles Dorman, Trinity College; Stephen CJ Parker and Tom Tullius; Boston University.

序列特异性DNA结合蛋白何以能在数量巨大的非特异性DNA中找到目标是一个长期未解之谜。一个比较受欢迎的模型是,序列是作为DNA螺旋的“大沟”中蛋白与碱基之间氢键的形成被读取的。对蛋白-DNA复合物三维结构所做的一项新的分析表明,DNA形状是识别的关键。DNA序列的前后部分通过让精氨酸优先与带负电的“口袋”结合改变DNA螺旋“小沟”的宽度。DNA在核小体核心颗粒中的定位是这一效应的一个例子。


6.预测蛋白汇聚的形式

P.L. Kastritis and A.M. Bonvin. "Are scoring functions in protein-protein docking ready to predict interactomes? Clues from a novel binding affinity benchmark," J Proteome Res, 9(5):2216-25. 2010. Eval by Antonio Rosato, University of Florence; Gloria Fuentes and Chandra Verma, Bioinformatics Institute.


7.肝脏miRNAs在疾病中作用

D.D. Young et al. "Small molecule modifiers of microRNA miR-122 function for the treatment of hepatitis C virus infection and hepatocellular carcinoma," J Am Chem Soc, 23: 7976-81. 2010. Eval by Subhash Sinha, The Scripps Research Institute; Nicholas Meanwell, Bristol Myers Squibb.

MicroRNA ( miRNA) 是一组保守的非编码小 RNA( non2coding small RNA) ,广泛分布在病毒、植物到哺乳动物中。目前,miRNA 已知的功能是在转录后水平调控基因的表达,主要作为基因表达的负调控因子。

近年的研究表明 ,miRNA 表达失调与多种肿瘤相关 ,并且这些 miRNA 可能起肿瘤抑制基因或癌基因的作用。MicroRNA 122 ( miR2122 ) 是肝脏特异高表达的miRNA,在小鼠胚胎植入 12.5d 后的胎肝中即可被检测,出生之前达到表达平台期,在成人的肝细胞中每个细胞表达量达 50 000 拷贝以上。

近来的研究发现 ,miR2122在肝癌组织中表达下调 , 同时在肝癌来源的细胞株中也低表达 , 如 Hep G2 和 Hep3B 等,在药物诱导的小鼠肝癌模型中,miR2122 表达同样下调 ,在大鼠移植肝癌中的变化也一样。这些研究结果提示 ,miR2122 表达下调是在肝癌发生过程中伴随发生的事件, 它也可能是肝癌的一个潜在的生物标志。

“Faculty of 1000 Biology”创办于2002年1月,是一种在线科研评价系统,其推荐原则立足于论文本身的科学意义而非发表在什么杂志上。该系统根据全球2300多名资深科学家的意见,提供对近期发表的生物科学论文的快速评论,目的是帮助广大科研人员遴选和发现有价值的研究工作。该机构专家根据论文对当前世界生物医学和临床实践的贡献程度和科学价值,每年对全球SCI文章总数不足千分之二的优秀精品医学论文进行推荐和点评,并赋予“F1000论文”称号向医学界推荐,涵盖了医学各个学科,是一项很高的学术荣誉。

(生物通:万纹)

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