Nature:中国正在致力推动蛋白质组学发展

【字体: 时间:2010年09月27日 来源:生物通

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  在过去的几年深圳华大基因研究院获得了一系列令人瞩目的基因组学研究成果,确立了中国在国际上的DNA测序领域的领先地位。本周中国的研究人员宣称他们将步入国际前沿对人体所有的蛋白质进行分类及特征描述。

  

    生物通报道  在过去的几年深圳华大基因研究院获得了一系列令人瞩目的基因组学研究成果,确立了中国在国际上的DNA测序领域的领先地位。本周中国的研究人员宣称他们将步入国际前沿对人体所有的蛋白质进行分类及特征描述。

    受到人类基因组计划的鼓舞,全世界的蛋白质研究人员一直致力于寻求资金资助开展蛋白质组研究,揭示基因组中编码信息导致人体正常及疾病状态的机制。

    今年1月,加拿大蒙特利尔国际人类蛋白质组研究组织( Human Proteome Organization ,HUPO)朝着国际化协作迈出了第一步,成立了人类蛋白质组计划(HPP)研究团队,研究人员对大约21,000个人类基因组蛋白质编码基因产物进行了特征描述。全世界的科研资助机构对此计划表示全力支持,给予了几十亿美元的资金支持。由于人类每个蛋白质都有可能以非特异方式被修饰,这就要求获取多个实验室的准确数据进行相互比较。

    蒙特利尔麦吉尔大学的蛋白质组学专家Tommy Nilsson说:“缺乏明显医学用途的项目已经被终止了资助。成百上千万的研究进入到了蛋白质组学领域,但所获甚少。血液和血浆的蛋白质组分析找到了疾病的蛋白质生物标记物,但目前还未有任何通过了详细的审查。”

    本周中国的研究人员在澳大利亚悉尼国际人类蛋白质组研究组织年会上宣布将计划发出挑战。由中科院院士贺福初领导的北京蛋白质组研究中心获得了每年约两亿人民币的资金资助。贺福初说:“我们将其命名为‘中国人类蛋白质组计划’,不久后资金预算将在启动资金的基础上再翻两倍,将项目扩展到对血液、大脑、肺、皮肤及其他的器官进行蛋白质组研究。中国政府计划对‘凤凰’实验室投入12亿人民币,‘凤凰’实验室早在数年前就已经开展这项研究计划。”

    “这样的投资是是史无前例的,”苏黎世瑞士联邦理工学院的蛋白质组学专家Ruedi Aebersold说:“中国大项目的启动将大大推动整个人类蛋白质组计划。”

    “凤凰”计划将引入北京大学核磁共振成像设备及清华大学的电子显微镜设备,中国科学院生物物理研究所将广泛参与蛋白质结构研究工作。

    预算的一半资金将投入到计划的核心项目——贺福初新的大型光谱学中心,该中心的位置靠近北京蛋白质组研究中心。计划重新购买20台新的质谱仪,这样中心质谱仪的总数将达到29台。将它们与机器流水线整合起来进行蛋白质的高通量处理,包括生物信息学分析。“这将是世界上第一个达到如此整合水平的实验室,”贺福初说。

    中国人类蛋白质组计划以贺福初院士构建的肝脏蛋白质组计划为基础,该系统包含了约7000个中国成人肝脏蛋白质。在悉尼会议上贺福初提出将以前未公布的蛋白质与蛋白质互作以及定位的相关数据拿出来进行讨论。

    德克萨斯休斯顿贝勒医学院的秦钧已被贺福初任命为质谱中心的首席技术主管。秦钧说将会建立几个由30-50人组成的团队利用“凤凰”的设备展开针对“大部分主要器官”的研究。人力资源将成为主要问题,他计划参观华大基因研究院寻求快速建立大规模实验室的意见和建议。“凤凰是一个理想的地方。在美国不会采用这样集中的方式从事这样的研究,”秦钧说。

    国际人类蛋白质组研究组织主管之一、麦吉尔大学John Bergeron同意秦钧的看法:“当我参观美国国立卫生研究所的时候我感到有点沮丧,我看到超过3个不同的机构从事肝脏蛋白质组学研究但他们之间完全没有任何交流。

    “数据分析是蛋白质组学的核心。现在正在对中国的数据进行严格的分析,我们应该在不久之后就能知道它们的价值,”Bergeron说:“如果数据被证实能达到标准,中国将在推动蛋白质组学向前发展方面处于领先地位。”

(生物通:何嫱)

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