Sanger microRNA数据库(miRBase)升级至17.0版[新品推荐]

【字体: 时间:2011年05月04日 来源:联川生物

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  2011年4月27日,Sanger microRNA序列数据库(miRBase)升级至17.0版。在新版本中,发夹前体序列升至16769条,新增1597条;成熟miR和miR*产物共19724条,新增2383条;新版本报道序列共涵盖153个物种。

2011年4月27日,Sanger microRNA序列数据库(miRBase)升级至17.0版。在新版本中,发夹前体序列升至16769条,新增1597条;成熟miR和miR*产物共19724条,新增2383条;新版本报道序列共涵盖153个物种。

新增microRNA序列动物中最具代表性的有Homo sapiens [人]新增376条, Branchiostoma floridae [文昌鱼] 新增78条,Ovis aries[土耳其盘羊] 新增51条,Mus musculus [小鼠]新增48条,Sus scrofa [猪]新增17条。植物物种中增长最为显著的是Brachypodium distachyon [二穗短柄草]增加120条。

此外 ,新版本中首次收录的物种共有9个,包括:

  • 6个动物物种:Petromyzon marinus[海七鳃鳗](244),Xenoturbella bocki[异涡虫](8),Heliconius melpomene [诗神袖蝶](2),Strigamia maritima[蜈蚣](4),Echinococcus granulosus[细粒棘球绦虫](23),Echinococcus multilocularis [多房棘球绦虫](22)
  • 3个植物物种:Rehmannia glutinosa[地黄](6),Theobroma cacao [可可](82),Saccharum spp. [甘蔗属](18)
  • Bandicoot papillomatosis carcinomatosis virus type 1 (1),Bandicoot papillomatosis carcinomatosis virus type 2 (1)

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关于miRBase
miRBase序列数据库是一个提供包括miRNA序列数据、注释、预测基因靶标等信息的全方位数据库,是存储miRNA信息最主要的公共数据库之一。miRBase提供便捷的网上查询服务,允许用户使用关键词或序列在线搜索已知的miRNA和靶标信息,详情请访问
http://www.mirbase.org/

关于LC Sciences与联川生物
LC Sciences(美国)是一家专业提供基因组及蛋白质组产品与服务的生物技术公司,提供下一代高通量测序服务,全方位的DNA,RNA及多肽微阵列服务,可用于核酸/蛋白表达谱与功能分析,生物标记发现和新药筛选,研发应用于诊断和生物传感的微型实验设备。基于专利的µParaflo®微流体技术,LC Sciences可提供具有高度灵活性和定制化的创新产品来满足客户快速变化的需求。联川生物作为LC Sciences在中国成立的全资子公司,随时为您提供最新的生物技术服务和前沿信息。

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