安徽医科大最新Nature Genetics文章

【字体: 时间:2011年06月14日 来源:生物通

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  来自安徽医科大学,上海交通大学附属新华医院、德国基尔大学等国内外30多家单位组成的研究小组采用全基因组关联研究方法,发现了特应性皮炎易感基因,这是目前亚洲地区首个、全世界样本量最大的特应性皮炎全基因组关联易感基因研究,标志着我国在该病的易感基因研究方面跻身世界先进行列。这一研究成果公布在Nature Genetics杂志上。

  

生物通报道:来自安徽医科大学,上海交通大学附属新华医院、德国基尔大学等国内外30多家单位组成的研究小组采用全基因组关联研究方法,发现了特应性皮炎易感基因,这是目前亚洲地区首个、全世界样本量最大的特应性皮炎全基因组关联易感基因研究,标志着我国在该病的易感基因研究方面跻身世界先进行列。这一研究成果公布在Nature Genetics杂志上。

文章的通讯作者是安徽医科大学张学军教授,以及上海交通大学附属新华医院姚志荣教授,其中张学军教授在皮肤遗传学领域获得了许多重要的成果,他不仅建立了目前世界上较为完整的皮肤病遗传资源库,收集和储存了近15万份皮肤病样本和资源,而且接连在Nature Genetics等杂志上发表文章,发现了银屑病、白癜风、系统性红斑狼疮和麻风的易感基因,这对于国内皮肤病遗传学研究起到了奠基性的作用,生物通也曾就其研究成果采访过他(专访安医大校长张学军:用最先进的方法赶超国际水平)。

特应性皮炎,又称异位性皮炎,是湿疹的一种特殊类型,好发于儿童,具有慢性复发,病程迁延,瘙痒剧烈,难以根治等特点,常伴发哮喘和过敏性鼻炎等自身免疫性疾病,且多数患者终身患病,对患儿的生长发育和成人的生活质量会造成严重影响,我国特应性皮炎的发病率约为3%。该病与遗传和环境因素密切相关,但具体病因不明。

在这篇文章中,研究人员前后历时3年多时间,采用全基因组关联研究方法,对近2万例特应性皮炎患者和健康对照者进行易感基因研究,在人类基因组2个区域内发现了与该病发病密切相关的4个易感基因,即5号染色体区域的TMEM232和SLC25A46;20号染色体区域的TNFRSF6B和ZGPAT;同时证实了既往在欧洲和亚洲人群中曾报道的易感基因FLG。研究发现,这些基因异常表现将导致特应性皮炎的发生。该研究实现了亚洲人群、欧美人群的国际性合作,突破了研究人群单一的局限,具代表性和科学性。

这项研究得到了国家863计划、“973”前期研究专项、国家自然科学基金、安徽省财政厅和科技厅专项基金等的资助,是目前亚洲地区首个、全世界样本量最大的特应性皮炎全基因组关联易感基因研究,标志着我国在该病的易感基因研究方面跻身世界先进行列。该研究构建了第一个亚洲人群特应性皮炎病例—对照的全基因组关联研究数据库,为今后该病的深入研究,并最终全面揭示其发病机制奠定了坚实的基础。

全基因组关联分析(Genome Wide Association Study,GWAS)主要基于“常见疾病,常见变异”(common disease,common variant)原理,可同时针对全基因组范围内的遗传变异进行基因分型,克服复杂疾病的遗传异质性和表型复杂性等,可以较好的避免实验结果的假阳性,因此发现疾病相关基因/位点的效力也显著强于以往的遗传研究方法。我国在该领域的研究虽起步较晚,但目前在复杂疾病GWAS研究上亦取得了多项令人可喜的成果。

2009年初,张学军教授研究小组率先完成了汉族人银屑病易感基因GWAS研究,成功发现汉族人银屑病非免疫相关基因LCE。随后顺利完成了系统性红斑狼疮、麻风、白癜风、食管癌易感基因GWAS研究,成功发现了几十种与汉族人相关这些复杂疾病的易感基因。之后又与美国密歇根大学、华盛顿大学,德国吉尔大学和复旦大学华山医院等国内外30多家单位共同参与完成的银屑病易感基因的GWAS深入研究,一举发现汉族人银屑病6个新的易感基因,证实银屑病遗传异质性的存在,为深入揭示其发病机制丰富了理论依据,标志着我国银屑病易感基因研究跻身世界领先水平。

(生物通:万纹)

原文摘要:

Genome-wide association study identifies two new susceptibility loci for atopic dermatitis in the Chinese Han population

Atopic dermatitis is a chronic, relapsing form of inflammatory skin disorder that is affected by genetic and environmental factors. We performed a genome-wide association study of atopic dermatitis in a Chinese Han population using 1,012 affected individuals (cases) and 1,362 controls followed by a replication study in an additional 3,624 cases and 12,197 controls of Chinese Han ethnicity, as well as 1,806 cases and 3,256 controls from Germany. We identified previously undescribed susceptibility loci at 5q22.1 (TMEM232 and SLC25A46, rs7701890, Pcombined = 3.15 × 10−9, odds ratio (OR) = 1.24) and 20q13.33 (TNFRSF6B and ZGPAT, rs6010620, Pcombined = 3.0 × 10−8, OR = 1.17) and replicated another previously reported locus at 1q21.3 (FLG, rs3126085, Pcombined = 5.90 × 10−12, OR = 0.82) in the Chinese sample. The 20q13.33 locus also showed evidence for association in the German sample (rs6010620, P = 2.87 × 10−5, OR = 1.25). Our study identifies new genetic susceptibility factors and suggests previously unidentified biological pathways in atopic dermatitis.

作者简介:

张学军
男,1955年8月出生,安徽宿松人。
1989年获安徽医科大学免疫学硕士学位,
1994年获复旦大学(原上海医科大学)皮肤病与性病博士学位。
享受国务院政府特殊津贴,首批国家“百千万人才工程”第一、二层次人选,卫生部有突出贡献中青年专家,教育部优秀骨干教师。

现任职务:
  安徽医科大学校长、
皮肤病学教育部重点实验室主任、
皮肤病学国家重点实验室培育基地负责人、
安徽医科大学皮肤病研究所所长。
安徽医科大学第二附属医院皮肤科主任

学术兼职:
亚洲皮肤科学学会副主席
中华医学会皮肤性病学分会主任委员
中国医师协会皮肤科医师分会副会长、
《Journal of Investigative Dermatology》编委(Associate editor)、
《Journal of Dermatological Science》编委(Associate editor)、
《International Journal of Dermatology》编委(Associate editor)、
美国Mayo Clinic客座教授(Visiting Professor)、
加拿大大不列颠哥伦比亚大学客座教授(Visiting Professor)、
复旦大学华山医院皮肤科兼职教授
国家自然科学基金委员会医学科学部专家咨询委员会委员、
吴阶平医学奖评审委员会委员等。
曾担任第九次国际皮肤科学大会秘书长。

研究领域:
  致力于皮肤遗传病,特别是复杂性皮肤病研究

  发表SCI论文156篇(责任作者120篇),累积影响因子757分(平均4.8),论文被他引1809次(截止2010年10月)。
  先后主持国家“九五”、“十五”“十一五”863计划项目、973计划前期专项、
国家自然科学基金重点项目和面上项目、世界艾滋病基金项目等国际国内项目10余项,取得了多项重要原创性成果。
主编包括普通高等学校国家级规划教材《皮肤性病学》第5、6、7版
主编卫生部医学研究生规划教材《医学科研论文的撰写与投稿》
主编及编写其它皮肤病学专著、教材和科普丛书等10部,

荣誉奖励:
获2007年度国家科学技术进步奖二等奖(主持人)
获2007年度教育部自然科学奖一等奖(主持人)
获2006年度中华医学科技奖一等奖(主持人)
获2005年度中华医学科技奖一等奖(主持人)
获2005年度教育部自然科学奖二等奖(主持人)
获2005年首届全国高等学校医药优秀教材奖一等奖(主持人)、
获2009年度中华医学科技奖医学科普奖(主持人)。
 

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