Life Tech推出取代芯片的RNA-Seq方案[新品推荐]

生物通报道，Life Technologies公司近日宣布，它推出了一个适用于Ion个人化操作基因组测序仪（PGM）的Ion Total RNA-Seq Kit。此试剂盒为转录本表达分析提供了一个快速、实惠且易用的方案，可取代芯片。

Ion PGM™是一种采用半导体技术的DNA个体化操作基因组测序仪，它可以在短短两个小时内完成高通量和高精确度的DNA测序。与其它新一代测序仪相比，它不需要激光、照相机或标记，价格当然要便宜很多。因此，它也被世界各地的研究人员所看好。

RNA-Seq是研究基因表达的理想方法，因为它提供了最完整的信息，如转录本定量以及新颖转录本及突变的检测。然而，新一代测序的费用和复杂度却让很多研究人员望而生畏。

昆士兰医学基因组学中心的主管Sean Grimmond博士也这样认为：“尽管RNA-Seq提供了理想的灵敏度及分辨力，但费用和速度正在拖它的后腿。而这两个领域正是Ion Torrent擅长的，因此，这将是一个非常引人注目的应用。”

Ambion开发的Ion Total RNA-Seq Kit能够分析任何类型的RNA，包括去除了rRNA的总RNA、poly(A) RNA及小RNA。与其他试剂盒不同，它保留了链信息，将所有读取与染色体链比对，提供了关于基因结构的关键信息。

Ion Torrent为开展RNA-Seq研究提供了一个完整的解决方案，从快速的文库制备和简单的测序，再到直观的数据分析工具。

Ion Total RNA-Seq Kit有着灵活的流程，可生成全转录组或小RNA文库。从200ng总RNA或5ng miRNA开始，文库构建低至6小时。Ion Total RNA-Seq Kit利用专利的Ambion技术以定向的方式加上接头，保留了链信息。此外，3’和5’接头同时加上，减少了连接和纯化步骤。文库经克隆扩增后，产生测序即用的模板。

Ion OneTouch™ 自动化流程能够在3小时内制备出测序模板，而手工操作只需几分钟。测序可在1小时内进行。序列读取由Torrent Server处理，并导出一个简单的文件，交由常用的基因组数据分析软件来分析。Partek Genomics Suite提供了一个直观的用户界面，可对RNA-Seq数据进行全面的分析。

Life Technologies将在下半年推出Ion 318芯片，它可将PGM个人化操作基因组测序仪每次运行的测序通量提高至1 GB，并可实现包括RNA在内的更多测序应用。Ion Torrent的创始人Rothberg预计年底前读长也会达到400 bp。点击索取Ion PGM测序仪的更多资料

（生物通 余亮）