纳米孔测序仪真机现身ASHG

Oxford Nanopore携带这两款测序仪现身本周在旧金山举行的美国人类遗传学协会的年会（ASHG），让我们一睹其芳容。不过，他们并未展示系统所产生的数据，但表示目前正在开展早期试用计划，将在该计划完成后开始商业化。

生物通报道 英国Oxford Nanopore Technologies公司在年初的基因组生物学技术进展年会（AGBT）上发布了一款便携式的基因组测序仪MinION，性能强劲，价格给力，引发市场轰动。然而，大半年过去了，纳米孔测序仪却迟迟不见踪影，连更早发布的GridION也未上市。于是，生物界开始议论纷纷，有人质疑是否有些技术障碍无法突破。

就在此时，Oxford Nanopore携带这两款测序仪现身本周在旧金山举行的美国人类遗传学协会的年会（ASHG），让我们一睹其芳容。一些参会者在SeqAnswers论坛上贴出了纳米孔测序仪的照片。

GridION系统使用带有多个蛋白纳米孔的阵列芯片来分析DNA、RNA和蛋白等。该芯片放置在一次性的cartridge内，cartridge随后上样到节点（node）内。用户可以连接若干个这样的节点，平行工作。在ASHG上，他们展示了两款cartridge，一款可上样一个样品，一款可上样96个样品。根据公司官员的说法，工程师们正在开发一款cartridge，以便上样384个样品。

从图片上来看，MinION并不如我们想象地那么小，比鼠标要长，有点像遥控器。MinION是即插即用的一次性系统，产量也不如GridION那么高。根据之前的介绍，此款仪器的售价低于900美元。

Oxford Nanopore之前曾表示，这两款系统都有望带来高达100 kb的读长，而原始错误率大约在4%左右。不过，在ASHG上，他们并未展示系统所产生的数据，但表示目前正在开展早期试用计划，将在该计划完成后开始商业化。不过，它并未提供一个时间表，也没有透露早期试用者的名单。

鉴于此，有人也博客上表达了他们的不满。一位“Mike the Mad Biologist”博主质疑，该公司是否能解决它所面临的挑战。“如果他们已经解决了插入缺失的问题，产生了很好的序列，比方说，大肠杆菌K-12基因组，那么他们为什么不公布数据？”

在评论中，一位网友“earonesty”提到，他们一直在申请一些MinION来测试各种样品类型，但被拒绝。他们也询问了一些参数，如预计的样品量和浓度，以便做好准备，但也没有回应。

如此看来，Oxford Nanopore可能还没有完全准备好。第三代测序仪当年来势汹汹，似乎随时能打败二代测序仪。然而，几年过去了，Helicos也许会关门，Complete Genomics可能被华大基因收购，而纳米孔测序仪也迟迟未上市，只有Pacific Biosciences还在艰难前行。（生物通 薄荷）

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