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GS FLX+ 2.8软件带来更多的出色表现[新品推荐]
【字体: 大 中 小 】 时间:2012年12月06日 来源:罗氏
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GS FLX+系统连续创新,基于同样的机器,相同的化学反应,推出新的v2.8软件,带来更优秀的测序表现。目前基于软件的优化可达到稳定的高质量,更长读长的Shotgun测序结果。
GS FLX+系统连续创新,基于同样的机器,相同的化学反应,推出新的v2.8软件,带来更优秀的测序表现。目前基于软件的优化可达到稳定的高质量,更长读长的Shotgun测序结果。
图1 GS FLX+系统用2.8软件对人DNA样本进行测序后的结果。曲线显示出碱基数随着序列长度的分布情况。蓝色部分与阴影交界处可看出50%的总碱基数与序列长度对应关系。不同测序结果与样本特性与基因组特性有关。
更长的读长更易于检测复杂基因组的全新变异,可对基因组、转录组和宏基因组学研究中一些测序困难的区域进行分析。
除了更长读长的表现,v2.8在GS Reference Mapper软件中增加了对多样本结果分离的功能,以及SNP检测效果上的提升。在GS Amplicon Variant Analyzer软件中增加了对单碱基插入缺失的自动查找,提供更加简便的Amplicon测序分析流程的构建。
许多升级至v2.8的用户都表示,v2.8的软件能带来读长上约200bp的提升,总体测序量上约20%的增加,454测序的超长读长在全基因组denovo拼接、cDNA拼接和可变剪切的检测方面都有优秀表现。