454测序应用于花生种子败育研究

【字体: 时间:2012年12月07日 来源:罗氏

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  近期,国内学者们使用454测序平台对花生种子的转录组进行了研究1,通过对地面上与地下的种子转录组cDNA文库进行测序与拼接,获得了近30,000条contig序列。

花生为豆科作物,是我国优质食用油主要油料品种之一,又名“落花生”或“长生果”,在全国各地均有种植,主要分布于辽宁、山东、河北、河南、江苏、福建、广东、广西、贵州、四川等地区。在花生种子的生长发育过程中,胚栓插入土壤,膨压将种皮推开后露出胚轴是一个重要过程,因此,胚栓入土失败、胚轴的膨压都有可能导致花生种子收益的损失。

近期,国内学者们使用454测序平台对花生种子的转录组进行了研究1,通过对地面上与地下的种子转录组cDNA文库进行测序与拼接,获得了近30,000条contig序列。在与已知数据库及其他模式植物的转录组进行了注释、功能上和代谢通路上的比较之后,发现光合作用通路在地面上的种子里有显著富集,并找到一些与在地面上的种子败育的潜在基因。

1. Chen, X., Zhu, W., Azam, S., Li, H., Zhu, F., Li, H., Hong, Y., Liu, H., Zhang, E., Wu, H., Yu, S., Zhou, G., Li, S., Zhong, N., Wen, S., Li, X., Knapp, S. J., Ozias-Akins, P., Varshney, R. K. and Liang, X. (2012), Deep sequencing analysis of the transcriptomes of peanut aerial and subterranean young pods identifies candidate genes related to early embryo abortion. Plant Biotechnology Journal. doi: 10.1111/pbi.12018

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