中科院基因组蛋白质组与生物信息学报首批在线预发表文章上线

　　

近日，由中国科学院北京基因组研究所主办的全英文学术期刊——《基因组蛋白质组与生物信息学报》（Genomics, Proteomics & Bioinformatics, GPB），首批在线预发表（Article-in-Press）文章成功上线。此次该刊物在线预发表功能的开通与使用，对于帮助科研人员及时发表自己的最新研究成果，使读者快速了解国内外的最新研究进展，以及提升GPB期刊的影响力都将起到积极作用。

自2003年创刊的近十年来，GBP一直遵循传统按期发表文章的出版模式，但随着人们对信息时效性的需求日益增长，为了缩短文章的发表周期，改善按期出版期刊的滞后性，从2012年6月开始，GPB将所有经过同行评议被接受的稿件，在ScienceDirect数据库中率先以在线预发表的形式提前发表，让文章更早地与读者见面，供大家阅读、引用。本期首批预发表的7篇文章，大家可通过以下介绍先睹为快：

1.　 本刊主编于军研究员就其十五年来关于基因组转录方面的研究成果发表了简短评论，对一些问题进行了更深入的思考，并对一些传统观点提出了新的挑战。

2.　 全基因组序列分析是生物信息学和计算生物学研究的基础，Bilal Wajid等人对过去数十年Genome Assembler的研究工作进行了总结，对二代测序技术的一般算法特点进行了综述，为初学者和感兴趣人员了解本领域提供了很好的帮助。

3.　 在于军研究员和胡松年研究员的指导下，崔鹏、刘万飞、赵宇慧等人对三甲基化组蛋白H3赖氨酸4（H3K4me3）进行了研究。他们通过比较小鼠大脑和睾丸组织中H3K4me3、H3K27me3的基因组图谱，发现该基因修饰与组织特异性表达、功能和发育密切相关。

4.　 以上研究小组的研究还发现H3K4me3在正义基因3′端有显著富集，被称为3′-H3K4me3，3′-H3K4me3区域可能是作为反义转录的潜在启动子而发挥作用，而这一现象可能在真核生物中普遍存在。

5.　 小麦白粉病是由于感染白粉病菌引起的，可导致小麦减产。本刊编委王向峰老师与中国农业大学孙其信、解超杰老师等人合作，对两种不同基因型（易感、抗病）小麦在白粉病菌感染前后的叶片进行了转录组比较研究。结果表明，抗白粉病是一种由大量基因参与调控的极度复杂的系统反应。

6.　 水牛是一种重要家畜，但其全基因组序列信息尚需完善。Subhash J. Jakhesara等人利用水牛肌肉组织来源的cDNA作探针，从其基因组中捕获Tissue Specific Temporal外显子并进行454测序，以揭示该物种的肌肉组织特异性基因和单核苷酸多态性，为研究尚未完成全基因组测序物种的编码序列变异情况，提供了新的策略。

7.　 非编码RNA（ncRNA）在转录水平调节基因表达方面起重要作用，但仍有许多ncRNA还有待进一步被发现。Michael Bao等人研发了一种基于ab initio的寻找基因组序列中ncRNA的新方法——ncRNAscout。与传统方法相比，该方法由于加入了最小自由能t-scores和SVP值这两个参数，因此能更精确地定位基因组中的ncRNA序列。该工具可在http://bioinformatics.njit.edu/ncRNAscout使用。

注：如您想阅读文章全文，请登陆GPB期刊预发表文章原文链接：http://www.sciencedirect.com/science/journal/aip/16720229.