科学家畅谈ddPCR技术的新兴应用[创新技巧]

【字体: 时间:2013年10月11日 来源:生物通

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  尽管Bio-Rad的微滴式数字PCR(ddPCR)技术才上市两年,但已在多个应用中崭露头角,表现出巨大的发展潜力。近日,多名科学家齐聚美国圣地亚哥,参加第二届CHI数字PCR会议,分享了推动他们研究的ddPCR应用。

尽管Bio-Rad的微滴式数字PCR(ddPCR)技术才上市两年,但已在多个应用中崭露头角,表现出巨大的发展潜力。近日,多名科学家齐聚美国圣地亚哥,参加第二届CHI数字PCR会议,分享了推动他们研究的ddPCR应用。

过去,研究人员在定量时常常会面临精度有限或灵敏度低的问题。多亏了数字PCR的出现,研究人员如今可从容面对更多“大海捞针”的问题。他们认为,ddPCR技术带来了更高的精度、重复性和灵敏度,适合靶点定量、拷贝数变异及罕见突变的检测。

“以HIV研究界为例,他们已受益于ddPCR能够实现更灵敏的测定,这也依赖于其高精度。要想拥有更高的灵敏度,这取决于能够区分有或没有。你需要一个本身噪音极低的系统,”Bio-Rad公司数字生物学中心的科学事务总监George Karlin-Neumann谈道。

加州大学圣地亚哥分校艾滋病研究中心的Matt Strain和Douglas Richman谈到了ddPCR的临床前景。他们早先验证了这项技术在HIV前病毒检测中的性能。随后,他们又与约翰霍普金斯儿童医疗中心的Deborah Persaud合作,利用该技术证明了出生时带有HIV病毒的婴儿被功能性治愈。

Strain博士认为,与实时定量PCR相比,ddPCR分析在整个动态范围内表现出精度和准确度的增加,特别是在低浓度时。此外,在使用微滴式数字PCR分析时,每个样品的总成本至少是芯片式数字PCR系统的1/10,甚至1/100。

在这次会议上,Richman博士还将介绍如何利用ddPCR来检测潜伏的HIV,包括分析大量细胞中的罕见事件,以及获取临床上相关的数据。

斯坦福大学医学院的助理教授Hanlee Ji领导的研究小组则专注于癌症遗传学的转化和临床问题,这些问题一旦回答,将有可能改善癌症患者的护理。研究人员已经开发出多种方法,来准确拷问癌症基因组,克服临床样品和遗传变异所造成的多个挑战。在这一努力过程中,微滴式数字PCR是他们的主要工具之一。

Ji博士认为:“微滴式数字PCR加快了我们的探索。考虑到其易用性、出色的准确性以及新分析的快速开发,ddPCR不断展现出广泛的实用性和未来诊断应用的潜力。”

如今,Ji博士正在使用Bio-Rad最新推出的第二代ddPCR仪器 – QX200。他将介绍如何利用ddPCR技术来追踪癌症、传染病及其他疾病中致病变异的存在、发展和消失,并讨论该技术在诊断上的潜力。

其他多名科学家以及Bio-Rad的应用专家还将介绍ddPCR技术的新兴应用,包括microRNA、单细胞基因表达、基因连锁、多重分析、EvaGreen应用以及NGS数据验证。(生物通 余亮)

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