Illumina TruSight组合让疾病研究更高效[新品推荐]

【字体: 时间:2013年11月01日 来源:生物通

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  为了实现特定疾病的经济高效、简化且靶向的新一代测序,Illumina提供了TruSight测序panel。由领先研究机构内公认的医疗保健专家选择,TruSight panel包含寡核苷酸探针,它们可靶定与特定疾病相关的基因和区域。

为了实现特定疾病的经济高效、简化且靶向的新一代测序,Illumina提供了TruSight测序panel。由领先研究机构内公认的医疗保健专家选择,TruSight panel包含寡核苷酸探针,它们可靶定与特定疾病相关的基因和区域。这些panel仅供科研使用,不能用于诊断;不过,实验室可根据CLIA的规定,在他们自己的实验室中利用这一内容来开发其独特的靶向检测。

目前上市的6种TruSight Panel

与医疗保健领域的公认专家密切合作,Illumina开发出6种TruSight测序panel。

TruSight One – 囊括> 4,800个基因,让实验室能够扩展其现有目录,简化流程,或创建完整的测序选项组合

由Illumina开发,TruSight One Sequencing Panel全面覆盖4,813个与临床表型相关的基因。实验室可分析panel上的全部基因,或有选择地关注特定亚群。通过这种方式,单个panel可有效代表整个新一代测序组合。

TruSight Tumor – 更深入了解实体瘤中的变化

TruSight Tumor Sequencing Panel包括26个基因和175个扩增子的相关内容,它们精选自CAP和NCCN指南以及后期临床试验结果。TruSight Tumor覆盖了COSMIC数据库中登记的癌基因变异所在区域的整个外显子,也覆盖了肿瘤抑制基因的所有外显子。这有助于更全面地查看实体瘤中的体细胞变异,包括肺、结肠、黑色素瘤、胃和卵巢。

TruSight Cancer – 针对之前与癌症易感性相关联的基因

与伦敦癌症研究所(ICR)的Nazneen Rahman博士及其团队合作开发,TruSight Cancer Sequencing Panel靶定已知在癌症中发挥作用的90多个基因,包括与常见(如乳腺癌、结肠直肠癌)和罕见癌症相关联的基因,此外,组合还包含了通过全基因组关联研究(GWAS)发现的与癌症相关的多个SNP。

TruSight Cardiomyopathy – 侧重于鉴定心肌病的遗传原因

与哈佛医学院个性化遗传医学联盟医疗中心(PCPGM)分子医学实验室(LMM)的Heidi Rehm博士及其团队合作开发,TruSight Cardiomyopathy Sequencing Panel靶定46个与心肌病相关的基因,包括肥厚型心肌病(HCM)、扩张型心肌病(DCM)、致心律失常型右室心肌病/儿茶酚胺敏感性多形性室性心动过速(ARVC/ CPVT)以及左室心肌致密化不全(LVNC)。这些内容是根据文献的认真回顾以及LMM在这些基因上的9年经验而选择的。其他内容来自一些综合征,如Danon病和Fabry病等,这些都表现为孤立的心肌病。

TruSight Inherited Disease – 侧重于严重、隐性的儿科疾病

与儿童慈善医院(CMH)儿科基因组医学的Stephen Kingsmore博士及其团队合作开发,Inherited Disease Sequencing Panel最初是基于448种疾病的panel,它用于孕前携带者检测,以筛查严重、隐性的儿童疾病,这项成果发表在《科学转化医学》上。原始内容经过CMH的Carol Saunders博士修订(按照ACMG检测超罕见遗传疾病的指引),以反映医学遗传学家的需求,主要关注儿童期发病的严重隐性疾病。智力障碍基因是由马普研究院的Hilger Ropers博士添加的。

TruSight Autism – 协助研究与自闭症相关的特征

与Kennedy Krieger研究所(KK)的Jonathan Pevsner博士及其团队合作开发,TruSight Autism Sequencing Panel靶定100个与自闭症明确关联的发育迟缓基因。它包括在线人类孟德尔遗传(OMIM)数据库中报道的自闭症基因;反复突变导致发育迟缓的基因;在案例研究中发现涉及发育迟缓特征的带有报告突变的基因;来自自闭症相关基因汇总的基因(如AutismKB9)。在缺乏突变的文献报道时,与强烈关联信号相邻的基因被排除。

如欲了解TruSight测序panel及Illumina新一代测序技术的更多信息,请访问www.illumina.com/trusight

亮点

专家设计的内容
内容由领先研究机构内公认的医疗保健专家选择,以针对特定的疾病

高质量的数据
为广泛采用且久经考验的Illumina新一代测序(NGS)技术而设计

DNA起始量低
低至50 ng DNA即可获得可靠的结果

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