2014技术展望:新一代测序

【字体: 时间:2013年12月19日 来源:生物通

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  虽然备受瞩目的基因组学Archon X奖已被取消,但基因组学研究不会停滞,测序技术仍将继续发展。在未来的一年,我们期待更多让人惊喜的创新。

新一代测序(NGS)技术一路走来,逐渐褪下其神秘面纱,进入越来越多的实验室。随着时间的推移,NGS系统从“高端大气上档次”的大型平台演化成满足个性化需求的台式测序仪。MiSeq、Ion Torrent和454 GS Junior这些仪器的上市,也推动了测序平台的普及。同时,MiSeqDx测序仪通过美国FDA认证,成为行业内一大里程碑事件,让NGS的临床应用成为现实。2014年,NGS技术将继续发展,可能会为我们带来更多惊喜。

纳米孔测序仪值得关注

Oxford Nanopore Technologies公司沉寂了一年之后,终于在11月底启动MinION测序仪的早期试用计划。2014年初,他们会将仪器发送给客户。据称,这个系统不需要文库制备,成本极低,且读长高达几十kb。这究竟是炒作,还是事实?答案将在明年揭晓。届时我们将看到许多有关纳米孔测序仪的数据。

临床应用有望扩展

Illumina的MiSeqDx系统于2013年6月和11月分别获得欧洲CE和美国FDA临床认证,成为世界上第一台可以开展临床检验的新一代高通量测序平台。明年,Life Technologies的Ion Torrent平台也有望获得FDA批准。至此,高通量测序将为遗传病、肿瘤和产前诊断带来革命性变化,有助于实现个性化医疗的承诺。当然,它也存在政策、法律和监管问题,而生物信息学工具也有待改善。

改装测序仪

随着使用的增加,研究人员对测序平台更加得心应手。当然,这也使得他们不再满足于现有的平台,而是尝试打开盖子,调整机器,以满足他们的个性化需求。之前,我们曾介绍过,麻省理工大学的高手曾成功调整Illumina测序仪,开展单个通道的测序。2014年,这方面的文章估计会越来越多。而这些调整也有望回到仪器开发者手中,纳入未来的系统更新。

新技术?

测序技术当然不会停滞,新的方法和技术仍在不断涌现。不久前在《Nature Nanotechnology》上,一组研究人员报道了在石墨烯纳米带上引入纳米孔,这比目前的绝缘膜明显更薄,有望提高纳米孔检测的速度和灵敏度。此外,单细胞测序也是一个研究热点。近日,一个研究小组在《Nature Biotechnology》上发表文章,介绍了一种新的聚合酶克隆和测序策略,将来可用于单细胞多样性的研究。

虽然备受瞩目的基因组学Archon X奖已被取消,但基因组学研究不会停滞,测序技术仍将继续发展。在未来的一年,我们期待更多让人惊喜的创新。(生物通 余亮)

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