华大科技解决杂合基因组组装难题[创新技巧]

【字体: 时间:2013年04月01日 来源:生物通

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  华大科技最新推出杂合基因组解决方案—Ultra-Deep De novo,可以帮助科研人员更加高效地解决杂合基因组组装难题。Ultra-Deep de novo方案将极大推动杂合基因组研究的进展,为快速获得这些物种的高质量基因组图谱提供了强有力的保障。

华大基因于2010年1月发起“千种动植物基因组计划”,截至2013年2月,已经启动了570多个物种基因组研究,但还有大量的物种基因组因杂合而无法解读。基因组杂合的情况广泛存在于具有重要经济或科研价值的物种中,传统的杂合基因组图谱绘制方案成本高、周期长,严重制约了这些物种基因组的解读。

为此,华大科技最新推出杂合基因组解决方案—Ultra-Deep De novo,可以帮助科研人员更加高效地解决杂合基因组组装难题。Ultra-Deep de novo方案将极大推动杂合基因组研究的进展,为快速获得这些物种的高质量基因组图谱提供了强有力的保障。

Ultra-Deep de novo方案基于新一代高通量测序技术,通过超高深度测序(>200X),采用最新版SOAPdenovo2软件进行组装,结合杂合序列识别算法,可以完整地保留并区分杂合区域的信息,从而大大提升了组装效果及基因组序列图谱质量。

与传统的杂合基因组图谱绘制方案相比,Ultra-Deep de novo所需的费用大幅下降,时间也大幅缩短,仅需6个月。而超高深度、全新软件、独创算法、超大片段文库,保证高质量图谱的获得。

Ultra-Deep de novo解决方案组装流程如下:

目前,华大科技已应用此方案完成了林木、昆虫、海洋等多个领域的杂合基因组图谱绘制工作。某植物的基因组大小为560Mb,基因组杂合度2.0%,其组装结果如表1所示。某动物的基因组大小为400Mb,基因组杂合度1.7%,其组装结果如表2所示。

全新快速转录组测序

随着新一代测序的发展,转录组研究已广泛应用于基础研究、临床诊断和药物研发等领域,可全面快速地获得特定细胞在某一状态下的几乎所有转录本序列信息。然而,转录组测序一般耗时较长,从样本到结果,大约需要两个多月的时间。

华大科技近日隆重推出全新快速转录组测序服务,只需20个工作日即可完成建库、测序和信息分析,并交付优质分析结果,助力功能基因组学研究,节约您的宝贵时间。即日起至2013年4月28日,前100个样本,每个样本仅需2万元!先到先得,立即体验!

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