-
生物通官微
陪你抓住生命科技
跳动的脉搏
新款SMART试剂盒助力RNA-Seq研究[新品推荐]
【字体: 大 中 小 】 时间:2013年05月07日 来源:生物通
编辑推荐:
Clontech的SMART家族再添新成员——SMARTer Universal Low Input RNA Kit for Sequencing。这一款试剂盒利用其金字招牌SMART技术,从降解的样品中合成cDNA,扩展了Clontech的新一代测序(NGS)方案,助力当今热门的转录组测序(RNA-Seq)研究。
生物通报道 Clontech的SMART家族再添新成员——SMARTer Universal Low Input RNA Kit for Sequencing。这一款试剂盒利用其金字招牌SMART技术,从降解的样品中合成cDNA,扩展了Clontech的新一代测序(NGS)方案,助力当今热门的转录组测序(RNA-Seq)研究。
RNA-Seq彻底改变了基因表达谱分析,让研究人员能够在核苷酸水平鉴定细胞的转录活性。这样能够定性定量地分析所有表达的基因,而无需预先假设。RNA-Seq为生物医学研究领域带来了许多重大进展,包括发育、癌症研究、植物学和神经学等领域的新发现。
SMARTer Universal Low Input RNA Kit将Clontech专利的SMART™技术与随机引物法相结合,有助于降解样品的转录组测序。对于生物学中常用的福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织和激光捕获显微切割(LCM)样品,其RNA往往降解,导致整体质量和产量不佳。此外,还有些RNA样品没有poly(A)尾巴,无法进行常规的cDNA合成。
SMART操作大大减少了RNA样品的处理,从而最大限度避免了样品损失的风险,保留了原始信息。在第一链合成过程中,cDNA两端已知序列的高效掺入让研究人员能够在单管中开展整个操作,而不必进行单独的接头连接。
此试剂盒可从2-10 ng质量不佳的总RNA中生成cDNA,用于RNA-Seq研究。其样品可来自FFPE或LCM材料,或RIN值较低,或未聚腺苷化的mRNA。试剂盒中包含了RT和PCR的酶,有10次反应和25次反应可供选择。
Clontech公司的总经理Carol Lou认为,通过这一新试剂盒,Clontech已将RNA-Seq的极限推至单细胞水平。“如今,我们正在扩展SMART技术的应用,包括从降解RNA或未聚腺苷化RNA样品中合成cDNA。我们期待SMARTer Universal Low Input RNA Kit for Sequencing受到RNA-Seq研究人员的欢迎。”
两年前,Clontech就推出了一个文库制备试剂盒——SMARTer Ultra Low RNA Kit for Illumina Sequencing。这一试剂盒利用oligo dT引物,能从10 pg – 100 ng总RNA中合成cDNA,适合极少量材料的转录组分析,如单细胞、循环肿瘤细胞或生物活检样品。(生物通 余亮)