单细胞水平的miRNA表达谱分析[新品推荐]

【字体: 时间:2013年08月16日 来源:生物通

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  Fluidigm公司近日宣布在其C1™ 单细胞自动制备系统上添加miRNA表达谱分析方案,有助于揭开单细胞中miRNA的秘密。这一方案为研究人员带来了简单、快速且灵活的流程,可扩增单个细胞中数百个miRNA,同时平行处理96个细胞。

生物通报道  Fluidigm公司近日宣布在其C1™ 单细胞自动制备系统上添加miRNA表达谱分析方案,有助于揭开单细胞中miRNA的秘密。这一方案为研究人员带来了简单、快速且灵活的流程,可扩增单个细胞中数百个miRNA,同时平行处理96个细胞。

这也是Fluidigm在C1系统上实现的第三个单细胞基因组学应用。之前,它推出了单细胞mRNA测序和单细胞基因表达分析。C1系统在去年上市,基于Fluidigm创新的微流体技术,能够让研究人员快速可靠地分离单个细胞并进行基因组分析。

microRNA(miRNA)这个小小的非编码RNA分子,行使着重要的调控功能。研究表明,miRNA可调控数千个蛋白编码基因,从而参与了多个生物学过程,包括分化、发育和细胞周期管理。miRNA还与许多常见病存在关联,如癌症和心血管疾病。

研究人员都希望揭开miRNA的更多秘密,然而,miRNA表达谱分析也存在两方面的挑战。首先,单个miRNA可靶定多个mRNA靶点,从而调控多个生物学系统。这种生物学现象是细胞间差异的一个促进因素,让miRNA靶点的解释变得困难。在单细胞水平研究miRNA的表达让研究人员可测定同一群体中某些细胞所发生的快速、动态变化。其次,传统的芯片分析费时费力,灵敏度不高,且内容不够灵活。而定量PCR虽提供了比芯片更高的灵敏度,但在大规模研究时成本高、时间长。

如今有了C1系统和miRNA表达谱分析方案,研究人员可在不到24小时的时间内,平行处理96个单细胞,在一张GE 96.96芯片对每个单细胞分别检测多达96种miRNA。配套的SINGuLAR™ 2.0分析软件可以对数据进行非监督式聚类分析及PCA分析,有效地根据miRNA表达类型在单细胞水平揭示细胞群体的异质性,为研究miRNA调控提供更多数据。

C1单细胞全自动制备系统是全世界最先推出的全自动单细胞分离和制备系统。C1系统为每次运行处理96个单细胞提供了简单轻松、高度重复的流程,而手工操作所需的时间极少。它前所未有地让分离细胞、提取、逆转录和扩增过程实现全面自动化,使细胞活性的检测和分析成为可能,并减少了多平台技术错误所引起的可变性。了解更多信息

Fluidigm公司单细胞基因组学业务的主管Candia Brown表示:“Fluidigm一直致力于扩大我们的单细胞应用菜单,这样研究人员就能在系统水平探索细胞网络。我们的客户需要一个扩展的工具包,以便探索生物学通路中的基因表达和基因调控。通过添加单细胞miRNA表达工具,我们为回答这些复杂的问题带来了简约、快速和规模。”(生物通 余亮)

延伸阅读:

使用自动化的微流控芯片系统在单细胞中检测MicroRNA的异质性

 

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