OncoScan唤醒您沉睡的FFPE样本[新品推荐]

【字体: 时间:2013年09月11日 来源:生物通

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  Affymetrix全新的OncoScan FFPE芯片利用独特的分子倒置探针(MIP)技术,能够快速经济地分析来自FFPE样本的少量的高度降解的DNA,让实体瘤癌症分析向前迈进了一大步。

从实体瘤样本中获得全基因组拷贝数和杂合性丢失(LOH)图谱可是个重大的挑战,因为FFPE样本高度降解,且DNA数量有限。传统的FISH和PCR方法只关注单个位点,且分辨率不高。新一代测序尽管很有潜力,但需要靶向富集和深度覆盖,才能获得异质FFPE样本的拷贝数信息。

癌症研究人员和临床医生正在寻找从FFPE实体瘤样本中获取高品质、全基因组拷贝数的解决方案,从而破译整个癌基因组拷贝数畸变的数量和复杂性。这些变化已经被证实是癌症重要的预后指标,同时也是理解癌细胞克隆演变的关键。

Affymetrix全新的OncoScan FFPE芯片利用独特的分子倒置探针(MIP)技术,能够快速经济地分析来自FFPE样本的少量的高度降解的DNA,让实体瘤癌症分析向前迈进了一大步。

这一新产品仅需80 ng起始DNA,在短短48小时内完成全基因组范围的实体瘤拷贝数分析,且在全基因组内大约900个已知的癌基因、杂合性缺失(LOH)上的分辨率极高,同时可以提供临床相关的获得性突变的数据。

OncoScan FFPE芯片为您带来:

■ 少量起始样本,快速获得结果 – 从80ng DNA到结果只需48小时

■ 一张芯片,多种数据 – 全基因组拷贝数(CNV)、杂合性缺失(LOH)、及关键的获得性突变(Somatic mutation)分析

■ 在约900个癌基因中,高分辨率拷贝数检测能力

■ 数据分析简单、快速 – 使用OncoScan™ Nexus Express软件能够在几分钟内分析上百个样本的拷贝数变化

在今年早些时候,ARUP实验室等领先的癌症研究机构已成功测试了该芯片。ARUP实验室的医学主管Sarah South谈道:“我们在多个实体瘤组织上开展了新的OncoScan™ FFPE芯片的测试,包括黑色素瘤、神经胶质瘤、乳腺癌和脂肪肉瘤,”。

“我们按照建议使用80 ng来自FFPE的DNA,并能够在48小时内完成分析。我们能够在一些关键癌基因(包括ERBB2、MDM2、EGFR和MYC)中检测到经FISH验证的畸变,表明OncoScan FFPE芯片可作为FISH检测的替代,来验证实体瘤组织中的癌基因畸变,且分辨率和特异性更高。由于OncoScan FFPE分析试剂盒有着全基因组的分辨率,我们也获得了这些样品中宝贵的拷贝数畸变的信息。”

立即索取OncoScan FFPE芯片的更多资料

预告一下,Affymetrix将在9月18日(周三)24:00举办在线讲座——唤醒您沉睡的FFPE样本,教您如何挖掘其中隐藏的所有信息!

在本次讲座中,演讲者将会向您:

• 讲述他们的实验方法如何加深对实体瘤的基因学基础的了解
• 探讨处理FFPE样本时遇到的技术难题
• 讨论他们的成果对未来的诊断、临床分级和治疗患者的意义
• 在线回答您提交的问题

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