多篇论文聚焦试管污染产生病毒

　　

生物通报道：今年早期，来自第三军医大学，美国国家心脏、肺和血液研究所的研究人员在《美国国家科学院院刊》（PNAS）杂志上发表了题为“Hybrid DNA virus in Chinese patients with seronegative hepatitis discovered by deep sequencing”的文章，发现了一种新病毒，并将其命名为NIH-CQV。

这种病毒来自患有血清阴性肝炎（seronegative hepatitis）的中国患者血清样品中，研究人员称NIH-CQV与带有“患者显著遗传异质性”的细小病毒和圆环病毒有关，但是还并不清楚这种病毒与患者疾病病因有何关联。

随着研究的推进，上周（9月11日）另外一组研究人员又公布了相关的最新研究成果：他们在一项类似的血清阴性肝炎研究的大量临床样品中发现了相同的病毒。这些样品的DNA和氨基酸序列几乎相同，也与NIH-CQV病毒的序列一致。由于这种病毒出现在所有混合样品中，因此研究人员怀疑这是由于污染导致的。这一研究成果公布在Journal of Virology杂志上。

之后研究人员又对独立样品进行了复检，这次采用了一种不同的技术来提取核酸，结果研究人员在样品中不再发现该种病毒了。由此他们认为可能是用于实验的Qiagen公司离心柱出现了污染。

为了找到这种病毒的来源，研究人员又将这种病毒与各种数据库中的病毒序列进行了比对，发现其与美国加州，以及俄勒冈州的海岸附近的样品宏基因组存在相似性。

作者在研究报告中写道，“由于这些数据的样品处理和生成过程并未涉及Qiagen公司的离心柱或试剂盒……因此这些研究结果表明，（污染）可能是来自于海水的一种环境病毒，在制造过程无意中污染了离心柱”。

目前Qiagen公司的的发言人Thomas Theuringer表示，公司正在检测这些产品，并尝试重复这一研究的结果。他指出，对于大多数实验应用来说，这种潜在的污染应该不会影响到结果。

“但是对于‘深度测序’，就像是这项研究中的测序工作，QIAamp UCP产品线也许比较合适，因为这比较于目前的标准方法，具有高出32倍的纯度水平”。客户可以更换其它产品。 “QIAGEN将会为所有购买了QIAamp Viral RNA Mini Kit，或QIAamp UltraSens Virus Kit，进行深度测序研究的客户进行免费更换，”Theuringer说。

来自哥伦比亚大学的病毒学家Vincent Racaniello在其博客上表示，这项研究令人回想起XMRV病毒的研究，这种逆转录病毒被认为与慢性疲劳综合征有关，但最终证明其实是来自于污染源。他表示深度测序是一种重要的研究工具，但是也要倍加小心，“从所用的水，到各种试剂”都要仔细控制。

“最重要的是，参与发现病原体的实验室必须分享他们的序列数据，以防此类情况的发生。”（生物通：张迪）

原文标题：

Hybrid DNA virus in Chinese patients with seronegative hepatitis discovered by deep sequencing

The Perils of Pathogen Discovery: Origin of a Novel Parvovirus-Like Hybrid Genome Traced to Nucleic Acid Extraction Spin Columns