研究无参基因组物种的利器——SSR分子标记

一次开发，终生受益

分子标记（Molecular Markers）目前广泛应用于遗传育种、基因组作图、基因定位、物种亲缘关系鉴别、基因库构建、基因克隆等方面。然而，传统的分子标记法成本高、耗时长、效率低，在高通量测序的时代，这些缺点尤其突出。为此，上海派森诺生物科技有限公司基于Roche 454 FLX+ 平台，推出了新型的SSR分子标记法。

分子标记（Molecular Markers），是以个体间遗传物质内核苷酸序列变异为基础的遗传标记，是DNA水平遗传多态性的直接的反映，目前广泛应用于遗传育种、基因组作图、基因定位、物种亲缘关系鉴别、基因库构建、基因克隆等方面。然而，传统的分子标记法成本高、耗时长、效率低，在高通量测序的时代，这些缺点尤其突出。为此，上海派森诺生物科技有限公司基于Roche 454 FLX+ 平台，推出了新型的SSR分子标记法。

SSR(Simple Sequence Repeats)标记是一种以特异引物PCR为基础的分子标记技术，也称为微卫星DNA(Microsatellite DNA)，是一类由几个核苷酸（一般为1~6个）为重复单位组成的长达几十个核苷酸的串联重复序列。与其它分子标记相比，SSR标记具有以下优点：(1)数量丰富，覆盖整个基因组，揭示的多态性高；(2)具有多等位基因的特性，提供的信息量高；(3)以孟德尔方式遗传，呈共显性；(4)每个位点由设计的引物顺序决定，便于不同的实验室相互交流合作开发引物。SSR分子标记开发的难点在于其两端保守序列的引物设计。目前只有少数已知基因组具有SSR序列库；而多数二代测序平台受制于读长较短，难以开发SSR分子标记。

上海派森诺生物科技有限公司拥有国内第一台Roche 454 GS FLX+平台，利用其高读长的优势成功完成了SSR分子标记技术的研发，构建了自己的探针库，是国内首家采用高通量测序进行SSR分子标记的公司。该项技术最大的突破在于打破了传统方法中模式生物的限制，对无参考基因组物种的研究提供了有力的工具，同时还具有高效、低成本的特点。一年多来，派森诺生物运用SSR分子标记开发法已完成多个项目，部分相关论文已经发表。

详细了解SSR分子标记技术

[1] Jarne, P.; Lagoda, P.J.L. Microsatellites, from molecules to populations and back. Tree 1996, 11, 424–429.
[2] Wang W, Li Z, Li Y. Isolation and Characterization of Microsatellite Markers for Cotinus coggygria Scop. (Anacardiaceae) by 454 Pyrosequencing. Molecules. 2014; 19(3):3813-3819.