强大的NGS分析软件CLC Genomics Workbench[新品推荐]

随着新一代测序（NGS）技术的发展，测序仪的通量不断提高，使得测序成本持续下降。这当然是大家喜闻乐见的。然而，海量数据的产生，也为数据分析带来了不小的挑战。好在强大的NGS分析软件不断出现，能帮助研究人员应对这一挑战。今天，我们就给大家介绍一款深受欢迎的软件CLC Genomics Workbench。

CLC Genomics Workbench由丹麦生物信息学软件公司CLC Bio（目前已被QIAGEN收购）开发，是第一个综合的软件分析包，可分析和显示所有主流测序仪产生的数据，如一代Sanger测序数据、二代SOLID、454以及 Illumina和Ion Torrent的数据、三代PacBio的数据，以及多种中间格式的数据如SAM/BAM等组装结果数据、GTF/GFF/GVF等注释文本数据以及自己编写的表格格式的数据。CLC Genomics Workbench可在Mac OS X，Windows和Linux平台运行，软件的运行系统由你选择。

CLC Genomics Workbench可以实现：对来自上述测序平台产出的原始数据的质量控制，包括原始数据的质量评估和data trimming以及PCR duplication的去除。多样本数据的自动分离。基因组数据的从头组装、重测序数据的mapping、SNP/InDel/CNV/SV突变检出和注释、比较基因组数据的分析以及结果的图形化展示。RNA-seq数据的差异表达分析和统计测验以及结果作图。小RNA数据的mapping、聚类和二级结构预测及功能注释。标签表达谱数据的分析。表观遗传学ChIP-seq数据的分析。

除了高通量数据分析，CLC Genomics Workbench可以实现常规分子生物学实验室的几乎所有生物信息学分析内容，如序列格式转换、多序列比对和进化发育树构建、序列开放读码框查找、序列特征参数分析、特征序列检索、BLAST、序列修剪和组装、引物和探针设计、限制性酶切位点分析和克隆图谱构建、蛋白质二级结构预测。在这些分析组件基础上，workflow功能可以实现完整的工作流，和软件提供的Batch批量分析功能结合，可以实现从原始数据导入到最终结果报告的批量分析，数据分析效率极高。此外，软件的Plugins插件功能提供了其他强大的分析功能，绝大多数为免费插件，可以根据自身需要灵活加载使用。

与其他软件相比，CLC Genomics Workbench的优势主要表现在：

• 图形化用户界面，安装和操作简单，类似Office软件的使用，无需命令行和编程技能，结果可以直观查看，并支持多种格式的输出，其图表结果可以直接用来发表文章。
• 支持包括Mac、Windows和Linux在内的多种操作系统平台，支持目前主流的所有测序平台数据和来自第三方软件的中间结果数据的导入分析和混合平台数据的分析。
• 自整合和开发的专有算法，较其他软件在分析速度和质量上都有明显优势。
• 软件自身整合了所有必要的功能，无需像其他软件间繁琐的上下游数据的格式转换，Workflow功能更能轻松自定义工作流，加上Batch批量分析，快速高效分析海量测序数据。
• 除了计算能力，CLC Genomics Workbench提供了灵活的工作队列系统，轻松整合其他应用程序和共享数据以及一系列的其他功能，确保你的高通量序列分析在快速、安全、和灵活的IT环境下运行。
• 使用说明文档和样本数据分析教程内容详尽，官网有每个功能组件的视频教程，上手容易。
• 软件的支持和维护服务周到，软件厂商QIAGEN资金雄厚，软件的开发维护团队强大，改进和升级速度快。

早在2008年，北京基因组研究所（BIG）就开始使用CLC Genomics Workbench软件。据介绍，他们之所以选择此软件，是因为它的灵活性好，而且能与他们自己开发的算法相兼容。另外，此软件速度快、用户界面友好而且功能齐全，一经使用，立即受到BIG研究人员的欢迎。

目前国内有几十个客户在使用此分析平台。他们感觉CLC Genomics Workbench操作简单，无需编程，结果直观并且图表可以直接发表，数据处理速度快，对硬件要求也不高，升级提醒和技术支持及时，节省了人力和时间成本，极大地提高了科研效率。

如今你再也不必担心不会编程了。只要具备基本的计算机操作技能，会用鼠标和键盘，简单地说就是能使用word等Office组件，就能使用此软件。此外，厂商会提供一次免费的上门安装和培训服务，之后提供线上的技术支持。

这么强大的软件，一定很贵吧。其实，现在有个团购优惠活动，仅需25000元，即可拥有CLC Genomics Workbench Educational License 1个，具备完整功能，永久使用 （含一年升级、维护与支持费用）。机会难得，赶紧参团或索取资料吧。

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