PacBio推出小而强大的测序系统[新品推荐]

【字体: 时间:2015年10月08日 来源:生物通

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  之前,人们一直在猜测Pacific Biosciences可能会推出小型的单分子测序仪,但PacBio从未给出肯定的答复。而在9月的最后一天,PacBio给了人们一个惊喜,突然宣布推出Sequel测序系统。Sequel系统保留了SMRT技术的优点,与现有的PacBio RS II系统相比,通量更高,但试剂成本更低。

之前,人们一直在猜测Pacific Biosciences可能会推出小型的单分子测序仪,但PacBio从未给出肯定的答复。而在9月的最后一天,PacBio给了人们一个惊喜,突然宣布推出Sequel测序系统。Sequel系统保留了SMRT技术的优点,与现有的PacBio RS II系统相比,通量更高,但试剂成本更低。

Sequel系统的核心是经过重新设计的SMRT Cell,它包含100万个ZMW(零模式波导),而PacBio RS II只有15万个。单个聚合酶被固定在ZMW中,以便实时观察和记录DNA测序。随着每个SMRT Cell的通量升高7倍,用户能够明显减少测序的时间和试剂成本,而前期的资金投入大约是之前的一半。Sequel系统的体积和重量大约是PacBio RS II的三分之一。由于它也是基于SMRT技术,故测序流程的许多方面都没有变化。

PacBio的CEO Michael Hunkapiller博士表示,Sequel系统带来了SMRT测序的优点,包括长读取、均一覆盖和甲基化信息。Hunkapiller博士希望这能带来毛利率的提升,并更快实现盈利。

同时,他也表示:“我们将继续支持PacBio RS II的客户,并不断引入样品制备、测序试剂和软件的改进,以扩展系统的性能。我们预计Sequel系统每年也会有类似的性能改进。此外,Sequel的结构允许通量的进一步扩展,通过改变未来SMRT Cell上ZMW的数量,可以针对特定应用来优化通量和操作成本。”

Sequel系统能够快速经济地生成高质量、全基因组的de novo组装。它也能鉴定各种类型的基因组变异,包括短读取测序技术无法触及的复杂区域的变异,同时揭示表观遗传的信息。利用该公司的Iso-Seq操作,此系统也能生成全长转录组的数据。Sequel系统的通量增加,也促进了SMRT技术在宏基因组学和靶向基因测序中的应用。

Sequel系统是PacBio与罗氏合作开发的,最终目标是制造出供临床使用的测序系统。根据此项协议,罗氏同意支付给PacBio总共4000万美元的里程碑付款。到目前为止,PacBio已获得了2000万美元,预计在2015年第四季度将获得剩下的2000万美元。据罗氏测序部门的负责人Dan Zabrowski介绍,这款测序平台将作为罗氏测序仪器的基础,最初用于临床研究,之后才用于体外诊断。

PacBio计划第四季度开始在美国限量发售Sequel系统,并在明年年初开始扩大Sequel系统和新SMRT Cell的生产。之后才开始在美国以外的地区发售。部分Sequel仪器将提供给罗氏,以扩展其内部的分析开发计划。这台仪器目前仅供科研使用。(生物通 余亮)

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