放眼转化医学市场，Affymetrix推出WT Pico Target Prep Kit

Affymetrix着眼于转化研究市场，推出其GeneChip WT Pico Kit。对于这一市场而言，其样本量有限，全转录组分析往往是个挑战。此试剂盒能够从低至100 pg总RNA中制备目标，用于该公司的GeneChip全转录组芯片。它适用于各种临床相关的样本，如福尔马林固定石蜡包埋的标本，以及新鲜和冷冻的组织、培养的细胞和全血样本。

　　

2015年4月21日
Doug Macron

来自纽约的消息（GenomeWeb）– Affymetrix着眼于转化研究市场，推出其GeneChip WT Pico Kit。对于这一市场而言，其样本量有限，全转录组分析往往是个挑战。

在特定组织或细胞群体中，存在有着“很大程度异质性”的细胞亚群，这是越来越明显的，Affymetrix的产品经理Christian Reese告诉GenomeWeb。

在癌症中尤为如此，肿瘤中一些小的细胞亚群带有不同突变，产生了“明显不同的突变图谱，这推动了基本生物学和疾病进程”，他说。

与此同时，人们正努力将基础发现转化成临床科学 – 癌症相关或其他 – 这往往需要使用难以获得的生物学样本。因此，研究人员“试图使用尽可能少的材料，以便为下游实验保留尽可能多的材料”。

还有一些研究人员在研究神经元等本身有限的细胞类型的表达模式。对于他们而言，同样的问题也存在，他指出。

为了解决这个问题，Affymetrix开发出WT Pico Kit。它能够从低至100 pg总RNA中制备目标，用于该公司的GeneChip全转录组芯片。据Reese介绍，这个起始量相当于10个细胞的转录组。

对于Affymetrix在转化研究领域的兴趣而言，重要的是，此试剂盒适用于各种临床相关的样本，如福尔马林固定石蜡包埋的标本，以及新鲜和冷冻的组织、培养的细胞和全血样本。它也与小的样本分离技术兼容，包括流式细胞仪、激光捕获显微切割和细针穿刺。

为了开发这个试剂盒，Affymetrix不得不对芯片上的目标扩增方式做出了一些调整，Affymetrix基因表达部门的试剂开发主管Chris Kubu谈道。

“我们的芯片通常使用体外转录，一种线性扩增方法……相比之下，大多数RNA-Seq方法都使用PCR步骤，”他解释道。“对于这个特定的试剂盒，我们确实在扩增所用的体外转录步骤之前使用了几个PCR循环，以便克服动力学障碍（与试剂盒中使用的酶相关）。”

“这可能是我们在分析开发过程中遇到的主要障碍，”他说。

Reese拒绝给出WT Pico Kit的具体定价，不过他说，“此试剂盒有一定的价值和复杂性，在定价上相对我们的其他的产品有某种程度的溢价”。

“不过，总的来说，客户支付的数额与目前Affymetrix的目标制备产品差不多，”他说。

立即索取WT Pico Target Prep Kit的详细资料