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意外发现促成第一篇DNAi论文(后生动物)
【字体: 大 中 小 】 时间:2015年07月02日 来源:生物通
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大阪大学的这个研究组在一种后生动物:尾海鞘(Oikopleura dioica)中发现了这种可以沉默基因的新形式:DNAi。
——通过一个偶然发现,研究人员首次报道了后生动物中以DNA为基础的基因沉默
生物通报道:来自日本大阪大学的Hiroki Nishida教授研究组近期发表了题为“DNA interference: DNA-induced gene silencing in the appendicularian Oikopleura dioica”的文章,意外的发现了尾海鞘(Oikopleura dioica)这种后生动物中存在以DNA为基础的沉默现象。这一研究成果公布在Proc R Soc B杂志上。
RNAi,也就是RNA干扰已经成为了分子生物学实验室中的一个利器,科学家们利用这种工具分析模式生物中特殊基因被敲除后所造成的影响,从而来锁定这种基因的功能。
而对于DNAi,可能大多数研究人员还并不熟悉,近期大阪大学的这个研究组就在一种后生动物:尾海鞘(Oikopleura dioica)中发现了这种可以沉默基因的新形式。
“我们发现DNA片段还有这样一个用处,”文章第一作者Tatsuya Omotezako说,这项发现很偶然,Omotezako表示这原本是他以为来自RNAi的一种表型,但是却通过DNAi获得了。
为了验证这是否是由于 DNAi引起的,Omotezako 和他的同事将一种广泛保守的发育基因:brachyury 的片段微注射到了尾海鞘的卵细胞内,结果他们发现发育幼虫会出现尾巴缺陷,而这与RNAi诱导的缺陷并不相同。同时注入双链 DNA 也会减少靶标mRNA转录和蛋白翻译的水平,这表明这种动物中出现了DNAi。
脊索动物有9个同源Argonaute蛋白,这些蛋白在多种植物和动物物种中参与RNAi的作用,同时也在一种细菌中参与了DNAi过程。来自埃克塞特大学,从事Argonaute蛋白研究的科学家Edze Westra表示,下一步将是对这些同源蛋白进行敲除,验证尾海鞘DNAi的生物学相关性。
Omotezako 说:“相对于RNA来说,DNA片段更容易准备,也能更快更便宜的获取,”因此这种DNAi也许能成为一种替代工具,Omotezako实验室目前打算利用DNAi分析尾海鞘的发育过程,找出其背后的机理。
(生物通:张迪)
原文检索:
T. Omotezako et al., “DNA interference: DNA-induced gene silencing in the appendicularian Oikopleura dioica,” Proc R Soc B, 282:20150435, 2015.