华裔学者新发Cell子刊:基因活性男女有别

【字体: 时间:2015年07月31日 来源:生物通

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  人体内有些基因几乎一直处于开启状态,有些基因用过之后就被闲置在一边,它们的活性都处于严格的调控之下。斯坦福大学的研究人员通过一种新技术,在T细胞中全面分析了调控序列的活性,揭示了调控组(Regulome)惊人的个体差异。这项研究于七月二十九日发表在Cell旗下的新期刊Cell Systems杂志上。

  

生物通报道:活化的调控序列上结合有转录因子,转录因子会招募其他蛋白启动基因。了解细胞中所有活跃的调控序列是很有意义的,

人体内有些基因几乎一直处于开启状态,有些基因用过之后就被闲置在一边,它们的活性都处于严格的调控之下。斯坦福大学的研究人员通过一种新技术,在T细胞中全面分析了调控序列的活性,揭示了调控组(Regulome)惊人的个体差异。这项研究于七月二十九日发表在Cell旗下的新期刊Cell Systems杂志上。

研究人员发现,开关模式存在个体差异的基因大多与自身免疫疾病有关。而且许多免疫系统基因的开关情况存在显著的性别差异。这也许就是女性更容易得自身免疫疾病的原因,比如硬皮病、红斑狼疮和风湿性关节炎。

“这项研究得益于我们开发的ATAC-seq,”文章的资深作者Howard Chang教授说。Howard Chang教授曾入选HHMI2009年早期职业科学家项目(2009 Early Career Scientist Program),获得百万美元资助。这项计划会在6年中为每一位入选科学家提供包括薪酬,福利和研究预算在内的,超过150万美元的经费支持,这些科学家也会被聘为霍华德休斯医学研究院的全职研究员。近几年Howard Chang教授多次在顶级期刊上发表重要成果。(延伸阅读:华裔学者Nature发表RNA技术突破

ATAC-seq只需要很少的细胞就能鉴定基因组中所有活跃的调控序列,可以用来实时了解人体内的情况。研究人员获得了12名健康志愿者的常规血样,并对其进行了研究。他们主要关注的是T细胞,因为T细胞比较容易从血样中分离,而且也是免疫系统的重要组分。研究人员希望在健康人中建立基因活性的基线,以便进一步研究疾病过程中发生的改变。

“我们希望全面了解人体的基因调控,寻找人与人之间的差异,”Chang教授说。“同卵双胞胎往往也不会同时患病。”这项研究显示,三分之一以上的基因活性差异与基因差异无关,说明环境在其中起到了很大的影响。“我认为大多数基因活性差异来自于非遗传学因素。”

研究人员指出,在12名健康志愿者中,7%的基因存在开关模式的个体差异。这些模式是长时间持续的,就像一种独特的指纹。而性别是决定基因开关倾向的最显著因素。

 

生物通编辑:叶予

生物通推荐原文:

Individuality and Variation of Personal Regulomes in Primary Human T Cells

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