绿色超级稻项目选择Affymetrix的Axiom® 基因分型平台来开发水稻新品种

【字体: 时间:2015年09月23日 来源:Affymetrix

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  Affymetrix今天宣布, Affymetrix已被绿色超级稻项目定为基因分型供应商。该项目开发的一部分工作,由中国农业科学院承担,计划在未来三年内开发至少15个水稻新品种,提供给包括中国在内的16个亚、非洲国家的小规模种植水稻的农民。

  

2015年9月21日,来自加利福尼亚州圣克拉拉的消息 – Affymetrix(纳斯达克代码:AFFX)今天宣布, Affymetrix已被绿色超级稻项目定为基因分型供应商。该项目开发的一部分工作,由中国农业科学院承担,计划在未来三年内开发至少15个水稻新品种,提供给包括中国在内的16个亚、非洲国家的小规模种植水稻的农民。

绿色超级稻(GSR)项目包括建设一个高效的基因分型平台,用于国际水稻研究领域的大规模分子育种活动。绿色超级稻项目获得了中国政府和比尔及梅琳达•盖茨基金会的支持,旨在通过开发和广泛使用绿色超级稻品种及相应的作物管理技术,提高资源有限的水稻种植者的收入。此项目的长期目标是让至少2000万资源有限的稻农受益,并将目标国家的水稻产量显著提高。

“我们很激动,也很高兴地看到,水稻研究领域在绿色超级稻项目中的努力取得了成果。绿色超级稻项目是世界上第一个水稻项目,在中国水稻科学家的努力下,帮助引领科学和育种上的突破,以便在目标国家发布适合生长的优良品种,”绿色超级稻项目的首席科学家、中国农业科学院作物科学研究所黎志康教授谈道。“我们选择Affymetrix的Axiom基因分型平台,是因为这个平台能够筛选数百万个标记,并将它们准确转移到更小的384HT格式芯片。这样的精确度和保真性是目前其他基因分型平台不具备的。”

专为绿色超级稻项目设计的基因分型芯片反映了水稻研究者前所未有的努力,利用了3000株水稻基因组重测序计划中发现的2000多万个水稻SNP。此芯片采用了一种新型的SNP标记筛选流程,对超过200万个标记进行选择,获得有着高的准确性和精确度,性状相关的和有价值的水稻SNP标记。

水稻筛选基因分型芯片上验证的200万个标记的子集,将以100%的准确性转移到Axiom 384HT格式上,设计成新的芯片。这款新的Axiom GSR Rice Array包含约55,000个标记,将实现超高通量的处理和384个样品的同时分析,并以一种极具成本效益的方式筛选数千个样品。

“我们很高兴能够支持绿色超级稻项目的目标,帮助水稻研究界开发出新品种,满足稻农的需求,并帮助实现可持续的水稻生产和粮食安全,”Affymetrix基因分型业务部门的高级副总裁兼总经理Laurent Bellon博士谈道。“Axiom平台出色的芯片设计、生物信息学和软件能力在推动全世界多个农业项目中扮演着重要的角色。Affymetrix致力于打造实际、易用且经济的先进技术,以满足农业领域的需求。”

有了Affymetrix先进的生物信息学和创新的设计策略,Axiom基因分型芯片设计一贯支持全基因组的基因分型应用,并准确的检出二倍体和多倍体物种的基因型。

如欲了解Axiom基因分型平台的更多信息,请访问www.affymetrix.com/agrigenotyping,了解农业基因组学上的应用。

了解Axiom基因分型平台的更多信息

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