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中国农科院程登发和周旭国组:有翅和无翅麦长管蚜microRNAs表达谱的差异分析
【字体: 大 中 小 】 时间:2016年12月12日 来源:联川生物
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麦长管蚜(Sitobion avenae(F.)),一种全球分布,对麦类作物极具破坏性的害虫,成虫分为有翅和无翅两种不同的形态变异,通过孤雌生殖繁育后代。在这项研究中,中国农业科学院程登发和周旭国课题组,利用小RNA测序对有翅及无翅麦长管蚜miRNAs表达谱进行分析与鉴定,并通过实时定量RT-PCR进行验证,以探究其调控机制。
microRNAs(miRNAs)是一类小片段、单链的非编码RNAs,调控基因的表达,尤其在动植物生长发育过程中。麦长管蚜(Sitobion avenae(F.)),一种全球分布,对麦类作物极具破坏性的害虫,成虫分为有翅和无翅两种不同的形态变异,通过孤雌生殖繁育后代。
在这项研究中,中国农业科学院程登发和周旭国课题组,利用小RNA测序对有翅及无翅麦长管蚜miRNAs表达谱进行分析与鉴定,并通过实时定量RT-PCR进行验证,以探究其调控机制。取由一个无翅雌性成虫孤雌生殖产生的,有翅和无翅全同胞成虫进行实验。小RNA测序结果表明,麦长管蚜中共鉴定出345个miRNAs,其中168个保守miRNAs,177个麦长管蚜特有miRNAs。miRNAs表达谱结果表明,在有翅和无翅麦长管蚜中,28个miRNAs表达显著差异,其中12个上调表达,16个下调表达。定量分析结果表明,无翅麦长管蚜中有5个miRNAs表达量显著低于有翅蚜。除miR-9a外,其余基因表达定量分析结果与测序结果一致。基于一个模式物种黑腹果蝇,四个蚜虫物种(豌豆长管蚜,桃蚜,橘蚜,棉蚜),预测出28个差异表达miRNAs的靶基因。KEGG富集预测结果表明,约有124个与代谢途径相关的基因受miRNAs调控,阐明了miRNAs调控的潜在功能,包括新陈代谢,发育,和有翼麦长管蚜的非遗传多型性。
图 有翅与无翅麦长管蚜miRNAs相对表达量
本研究中的小RNA测序由联川生物协助完成。
用户文章
Li XR,et al.(2016)Comparative profiling ofmicroRNAs in the winged and wingless English grain aphid, Sitobion avenae (F.) (Homoptera:Aphididae).Scientific Reports. DOI: 10.1038/srep35668
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