电子科技大学Nature Genetics发表测序新成果

【字体: 时间:2016年04月20日 来源:生物通

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  来自电子科技大学、中科院和新加坡国家眼科中心等机构的研究人员发现,FGD6基因中的一个错义变异提高了息肉状脉络膜血管病变(polypoidal choroidal vasculopathy,PCV)的风险。这一研究发现发布在4月18日的《自然遗传学》(Nature Genetics)杂志上。

  

生物通报道  来自电子科技大学、中科院和新加坡国家眼科中心等机构的研究人员发现,FGD6基因中的一个错义变异提高了息肉状脉络膜血管病变(polypoidal choroidal vasculopathy,PCV)的风险。这一研究发现发布在4月18日的《自然遗传学》(Nature Genetics)杂志上。

任职于电子科技大学医学院和中科院成都生物研究所的杨正林(Zhenglin Yang)教授是这篇论文的通讯作者。杨教授是我国眼睛疾病基因研究领域的知名专家。2006年,杨正林作为第一作者的研究论文入选了Science杂志年度世界科技十大突破。在这篇论文,他与合作者们定位了老年黄斑病变(AMD)在人类染色体10q26上的精确基因,这有助于开发AMD的诊断和治疗(四川大学等《科学》快讯发表突破性进展)。

2014年8月,杨正林教授与重庆医科大学附属第一医院的杨培增教授合作,通过全基因组关联研究(GWAS)鉴别出了伏格特小柳原田综合征(VKH)新风险位点。相关论文发表在Nature Genetics杂志上,为VKH综合征的遗传学和生物学提供了更多的见解(重庆医科大学Nature子刊发表GWAS新成果)。同月,杨正林教授再与复旦大学的孙兴怀教授合作,采用GWAS鉴别出了与原发性开角型青光眼相关的新易感基因。研究结果发表在Nature Genetics杂志上(中国科学家Nature Genetics发表GWAS研究新成果 )。

AMD是老年人失明的主要原因。预计到2020年,AMD患者数量将达到1.96亿人,到2040年这一数字将增加到2.88亿。在西方文章中,AMD晚期阶段通常被分为脉络膜新生血管(CNV,或湿性AMD)和地图状萎缩(或干性AMD)两种类型。然而,在上世纪80年代早期,一种称作为PCV的AMD亚型被确定为不同于典型的CNV形式。

PCV是一种常见的脉络膜血管疾病,吲哚青绿血管造影(ICGA)确诊可见到特征性的血管瘤样扩张的结构,即所谓“息肉状病灶”或/和异常分支血管网。仅在中国,估计就有168万的新生血管性AMD患者,其中近90万人罹患PCV。从临床角度看,PCV和CNV都是因新血管生长及液体积聚所致,均可导致视网膜下出血、色素上皮脱离(PED),及因出血、渗漏及瘢痕组织形成造成的视力丧失。尽管具有这些相似性,出于几个原因人们认为PCV和CNV是湿性AMD的不同亚型。而相比于CNV亚型,当前对于PCV的遗传风险因子仍不是很清楚。

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在新研究论文中,研究人员报告称他们首先对一个中国汉族组群进行了外显子组测序,随后在4个独立组群中进行了重复研究,鉴别出FGD6基因中一个罕见的c.986A>G (p.Lys329Arg)变异与PCV(而非CNV)显著相关。他们发现FGD6-Arg329的细胞内定位不同于FGD6-Lys329。在体外,FGD6可以调控促血管生成活性,氧化磷脂可以提高FGD6的表达。在小鼠视网膜中FGD6-Arg329比FGD6-Lys329促进了更加异常的血管生成。

新研究数据表明,氧化磷脂和FGD6-Arg329有可能协同作用提高了PCV的易感性。

作者简介:

杨正林

眼睛疾病基因领域研究的著名专家,现任电子科技大学医学院院长、电子科技大学附属医院四川省人民医院副院长,国家杰出青年基金获得者,发表SCI论文70多篇(包括New England Journal of Medicine,Science, American Journalof Human Genetics等顶级学术杂志),其第一作者论文入选Science杂志2006年评出的世界科技十大突破第六项内容。

(生物通:何嫱)

生物通推荐原文摘要:

A missense variant in FGD6 confers increased risk of polypoidal choroidal vasculopathy

Polypoidal choroidal vasculopathy (PCV), a subtype of 'wet' age-related macular degeneration (AMD), constitutes up to 55% of cases of wet AMD in Asian patients. In contrast to the choroidal neovascularization (CNV) subtype, the genetic risk factors for PCV are relatively unknown. Exome sequencing analysis of a Han Chinese cohort followed by replication in four independent cohorts identified a rare c.986A>G (p.Lys329Arg) variant in the FGD6 gene as significantly associated with PCV (P = 2.19 × 10−16, odds ratio (OR) = 2.12) but not with CNV (P = 0.26, OR = 1.13). The intracellular localization of FGD6-Arg329 is distinct from that of FGD6-Lys329. In vitro, FGD6 could regulate proangiogenic activity, and oxidized phospholipids increased expression of FGD6. FGD6-Arg329 promoted more abnormal vessel development in the mouse retina than FGD6-Lys329. Collectively, our data suggest that oxidized phospholipids and FGD6-Arg329 might act synergistically to increase susceptibility to PCV.

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