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10X Genomics发布升级版测序平台[新品推荐]

【字体: www.ebiotrade.com 时间:2016年5月24日 来源:生物通

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  备受关注的测序公司10X Genomics近日宣布正式推出升级版测序平台Chromium系统。此系统是基于原先的10X GemCode技术,但包含了一系列完整的流程方案,可实现多个应用。

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生物通报道 备受关注的测序公司10X Genomics近日宣布正式推出升级版测序平台Chromium系统。此系统是基于原先的10X GemCode技术,但包含了一系列完整的流程方案,可实现多个应用。

生物通的读者也许对10X Genomics的GemCode测序平台并不陌生。这是一套分子条形码和分析系统,由仪器、试剂盒和信息学软件组成。它能与Illumina的测序仪结合使用,从短序列中获得结构变异、单体型及其他一些有价值的长片段信息。此系统也被生物通读者评为“2015生命科学创新产品”。

Chromium系统的上市对10X Genomics和基因组研究界而言有着里程碑的意义。据CEO Serge Saxonov介绍,此系统实现了多个应用,让客户能够获取通过其他方式无法获得的关键信息。“对于那些希望从实验中获取最大价值并与现有流程无缝整合的研究人员和临床医生而言,我们认为Chromium系统将是十分宝贵的,”他说。

Chromium系统包含一套完整的流程方案,具体包括:

Chromium Single Cell 3’ Solution,以单个细胞为基础开展高通量的基因表达谱分析,实现复杂细胞群体的深度分析。追踪单个细胞的表达谱可确保生物学相关的信号不被平均化测定所掩盖。

Chromium Genome Solution,在全基因组规模提供了全面的Linked-Read信息,综合了短序列数据和长片段信息。它实现了变异检出、分相以及基因组结构的广泛鉴定,有助于鉴定遗传病中的关键变异,并发现癌症中的重要改变。

Chromium Exome Solution,提供了Linked-Read信息,用于分相、结构变异检测和拷贝数确定,也让研究人员能够了解低复杂度和重复性的区域,而之前利用短读长测序,这些区域也许错过了。

此外,Supernova™ Assembler 也将带来高质量、低成本的二倍体de novo组装。不久前,《Nature Methods》上发表了一种新的de novo人类基因组序列组装方法,正是基于10X Genomics的linked-read数据。(延伸阅读:De Novo基因组序列组装的新方法

10X Genomics在近日召开的欧洲人类遗传学会(ESHG)大会上展示了Chromium系统的全基因组和外显子组应用。下月初,它将与自然出版集团联合举办网络研讨会,由费城儿童医院的专家介绍如何捕获外显子组中的“暗物质”。(生物通 余亮)

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