中国林科院卢孟柱课题组:转录组及降解组技术对毛白杨次生维管系统再生microRNA的鉴定

【字体: 时间:2017年01月17日 来源:联川生物

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  这项研究中,中国林业科学院卢孟柱课题组使用小RNA测序和降解组测序技术,研究不同剥皮时间后,毛白杨miRNAs参与SVS再生的表达情况。实验中取材四年生毛白杨树干,环状剥皮后7, 10, 12, 16, 18,和21天的再生组织。

  

木材的形成是一个复杂的发展过程,主要由转录网络调控。microRNA (miRNA)通过mRNA降解和翻译抑制,调节植物生长发育过程中靶基因的表达。

这项研究中,中国林业科学院卢孟柱课题组使用小RNA测序和降解组测序技术,研究不同剥皮时间后,毛白杨miRNAs参与SVS再生的表达情况。实验中取材四年生毛白杨树干,环状剥皮后7, 10, 12, 16, 18,和21天的再生组织。

小RNA测序结果表明,在再生组织中共发现209个已知miRNAs,187个新miRNAs。

降解组测序分析发现,157个靶基因由21个已知miRNAs控制,75个靶基因由30个新miRNAs调控。

GO分析结果表明,15个miRNAs的靶基因在生长素信号通路、细胞分化,分生组织发育中富集表达。

次生维管系统再生主要包括维管形成层启动,形成和分化阶段的连续过程。


 
靶基因表达谱

本研究为miRNAs在SVS再生调控方面发挥的作用提供了理论依据。

本研究中降解组测序由联川生物协助完成。

用户文章
Tang F, et al.(2016) Identification of microRNAs Involved in Regeneration of the Secondary Vascular System in Populus tomentosa Carr. Frontiers in Plant Science. Doi:10.3389/fpls.2016.00724

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