顶级癌症论文的重复性究竟如何?首批结果已出炉

【字体: 时间:2017年01月22日 来源:生物通

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  生物学论文难以重复,这已是一个引起人们广泛关注的问题。近日,癌症生物学重现性项目(Reproducibility Project: Cancer Biology)在eLife上发表首批结果,发现情况不容乐观。在他们验证的5篇论文中,只有2篇能够重复出来。

  

生物通报道  生物学论文难以重复,这已是一个引起人们广泛关注的问题。近日,癌症生物学重现性项目(Reproducibility Project: Cancer Biology)在eLife上发表首批结果,发现情况不容乐观。在他们验证的5篇论文中,只有2篇能够重复出来。

2012年,Amgen公司的研究人员在Nature上发表评论文章,宣布他们未能重复53篇重要癌症论文中的47篇。无独有偶,Bayer的研究小组也发现了这一问题。根据Bayer的报告,75-80%的项目被迫终止,因为基础研究的成果无法重复。

于是,癌症生物学重现性项目于2013年启动,旨在审查50篇在Science、Nature和Cell等顶级杂志上发表的临床前癌症研究的主要结果。不过,因为时间和经费的问题,这个项目的规模已从50篇缩减到29篇。相关人士指出,每项重复工作平均耗时7个月,成本大约为27,000美元。

本周,该项目在eLife上发表了他们重复五项研究的结果。报道称,它能够很好地重复其中两项研究,但这些重复工作也遇到了自己的问题。另外两项研究不太好解释,而最后一项研究似乎无法重复。

可重复的研究

Sirota, M. et al. Sci. Transl. Med. 3, 96ra77 (2011)
这项研究证明了溃疡药物可减慢肿瘤的生长。它能够被重复,但统计分析有些不一致。

Delmore, J. E. et al. Cell 146, 904–917 (2011)
这项研究发现阻断蛋白序列可以抑制癌基因。它也能够被重复,但对照组的生物发光/存活存在明显不同。

无法解释的研究

Willingham, S. B. et al. Proc. Natl Acad. Sci. USA 109, 6662–6667 (2012)
这项研究发现,阻断CD47与另一个蛋白之间的接触可抑制肿瘤。验证工作主要针对处理肿瘤的生长和转移,但发现结果无法解释,因为一些肿瘤存在自发抑制。

Berger, M. F. et al. Nature 485, 502–506 (2012)
这项研究通过测序发现了黑色素瘤中频繁突变的基因。然而,验证工作却发现,没有突变的肿瘤也生长得很快,难以支持文章的结论。

无法重复的研究

Sugahara, K. N. et al. Science 328, 1031–1035 (2010)
这项研究发现一种肽段能帮助化疗药物渗透到肿瘤细胞中,从而增强其作用。不过,验证工作却发现这种肽段在小鼠身上并没有此作用。

Nature杂志与所有这些论文的通讯作者对话。一些人赞扬了重现性项目,而另一些人则担心这个项目可能会抹黑他们的工作。加州大学圣芭芭拉分校的Erkki Ruoslahti是那项无法重复的研究的通讯作者。他计划今年对癌症患者进行一项药物试验,但现在他的计划可能有危险。

Ruoslahti对研究结果的裁定提出异议。他指出,美国、欧洲、中国、韩国和日本至少有10个实验室已经验证了2010年的这篇论文。“难道我们实验室中三代的博士后都在自欺欺人,所有的人都在做同样的事情?我难以相信,”他说。

不过,也有科学家认为,重复工作的失败可能归因于文章中的方法细节太少。重复的团队花了很多时间与原始作者沟通实验操作和试剂,但在许多情况下,开发实验操作的学生和博士后已经不在实验室中。因此,实验操作可能存在细微的差别。其他人则认为,这个项目的主要价值在于鼓励人们去怀疑。(生物通  薄荷)

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