Nature子刊:首次解析了TALE蛋白对DNA表观修饰的特异性识别

【字体: 时间:2017年11月01日 来源:生物通

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  北京大学生命科学学院的研究人员发表了题为“Deciphering TAL effectors for 5-methylcytosine and 5-hydroxymethylcytosine recognition”的研究论文,首次全面解码了TALE蛋白对DNA表观修饰5-甲基胞嘧啶(5mC)和5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)的特异性识别。

  

北京大学生命科学学院的研究人员发表了题为“Deciphering TAL effectors for 5-methylcytosine and 5-hydroxymethylcytosine recognition”的研究论文,首次全面解码了TALE蛋白对DNA表观修饰5-甲基胞嘧啶(5mC)和5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)的特异性识别。

这一研究成果公布在Nature communications杂志上,由北京大学生科院伊成器课题组与魏文胜研究组合作完成,张媛博士,博士生刘璐璐、郭生杰及宋靖慧为该论文的并列第一作者。

TALE蛋白是二代基因编辑工具TALEN的核心识别模块;其由若干个长约34个氨基酸的重复单元组成,每个重复单元利用第12、13个氨基酸(RVD, repeat-variable diresidue)与DNA碱基发生相互作用,从而实现对DNA的序列特异性识别。因为RVD与DNA碱基直接相互作用,所以TALE-DNA相互作用对DNA修饰敏感;而作为第三代基因编辑工具的CRISPR/cas则不具备这一特点。

在这项工作中,研究团队筛选了全部理论上的RVD组合对5mC及5hmC这两种重要表观遗传修饰的识别,并由此鉴定出5mC、5hmC的特异性及简并性识别RVD。应用这些新型RVD,该研究实现了活细胞中甲基化依赖的基因激活和基因编辑,也在体外实现了单碱基分辨率的5hmC检测。这项工作为基于TALE蛋白的甲基化特异性基因激活、抑制及基因编辑等提供了依据。


全面解码TALE蛋白对5-甲基胞嘧啶及5-羟甲基胞嘧啶的特异性识别

原文标题:

 Deciphering TAL effectors for 5-methylcytosine and 5-hydroxymethylcytosine recognition


 

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