MCP:一种肿瘤相关lncRNA在肝癌细胞中的分子调控网络

【字体: 时间:2017年11月09日 来源:生物通

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  最新研究系统地揭示了一种肿瘤相关的长链非编码RNA HOTAIR在肝癌细胞中的分子调控网络,表明定量蛋白质组学技术可以从系统和整体的角度阐明细胞或生物体非编码RNA的蛋白调控网络及分子作用机制,是非编码RNA功能研究不可或缺的重要工具。

  

非编码RNA(non-coding RNA, ncRNA)是指不能编码产生蛋白质的RNA分子,种类众多,包括微小RNA(miRNA),长链非编码RNA(lncRNA),环状RNA(circRNA)等。越来越多的研究表明非编码RNA具有重要且复杂的生物学功能。

来自中科院水生所的研究人员发表了题为“Integrated proteomic and transcriptomic analysis revealslong noncoding RNA HOTAIR promotes hepatocellular carcinoma cell proliferation by regulating opioid growth factor receptor (OGFr)”的文章,系统地揭示了一种肿瘤相关的长链非编码RNA HOTAIR在肝癌细胞中的分子调控网络,表明定量蛋白质组学技术可以从系统和整体的角度阐明细胞或生物体非编码RNA的蛋白调控网络及分子作用机制,是非编码RNA功能研究不可或缺的重要工具。

这一研究成果公布在国际蛋白质组学专业杂志Molecular & Cellular Proteomics上,由中科院水生所葛峰课题组完成。

葛峰课题组长期以来致力于采用定量蛋白质组学技术来揭示非编码RNA的分子调控网络及其作用机制并取得了系列的研究成果(Journal of Proteome Research, 2012; 11(4):2078-90; Molecular & Cellular Proteomics, 2015; 14(6):1447-63)。

在以上工作的基础上, 葛峰课题组针对Dre-miR-21这种影响斑马鱼胚胎早期心血管发育的miRNA,采用定量蛋白质组学技术构建了dre-miR-21在斑马鱼早期胚胎中的蛋白调控网络,揭示了dre-miR-21在斑马鱼胚胎发育过程中的新的调控机制(Scientific Reports, 2017; 7(1):4022);针对一种与多种癌症和神经性疾病发生相关的环状RNA分子CDR1as,揭示了其在肝癌细胞中的蛋白调控网络,发现CDR1as可通过靶向miR-7分子从而调控表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor, EGFR)的表达,进而影响肝癌细胞的增殖(Journal of Proteome Research,2017; 16(10):3891-3902)。

葛峰课题组进一步通过采用转录组和定量蛋白质组学的整合分析策略,系统地揭示了一种肿瘤相关的长链非编码RNA HOTAIR在肝癌细胞中的分子调控网络,发现HOTAIR对肝癌细胞增殖的促进作用可以通过调控阿片生长因子受体(Opioid growth factor receptor, OGFr)的表达来实现,而该调控机制可能在各种类型的肿瘤细胞中普遍存在。


转录组和定量蛋白组整合分析研究长链非编码RNA HOTAIR的分子调控网络及其功能靶标分子

这些研究成果不仅揭示了多种不同类型非编码RNA新的分子作用机制, 也表明定量蛋白质组学技术可以从系统和整体的角度阐明细胞或生物体非编码RNA的蛋白调控网络及分子作用机制,是非编码RNA功能研究不可或缺的重要工具。

原文标题:

Integrated proteomic and transcriptomic analysis revealslong noncoding RNA HOTAIR promotes hepatocellular carcinoma cell proliferation by regulating opioid growth factor receptor (OGFr)

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