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再见!药物机制研究的单兵作战时代!

【字体: www.ebiotrade.com 时间:2017年12月14日 来源:吉凯基因

摘要:

  吉凯基因的全基因组Cas9文库筛选震撼来袭!将CRISPR/Cas9载体文库包装成慢病毒。敲除文库包含122411种sgRNA靶点,其中19050种编码基因、1864种microRNA;过表达文库包含70290种SAM-sgRNA靶点,涵盖23430种编码基因转录本。

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药物研发难,难于上青天,作用机制研究是关键。
大荧幕上钢铁侠和美队在撕逼,抗肿瘤药物的机制研究亦难分高下,各种靶点通路粉墨登场,到底哪家强?
酪氨酸激酶?血管新生?肿瘤细胞周期相关因子?组蛋白去乙酰酶抑制剂?肿瘤微环境?肿瘤干细胞?肿瘤代谢异常?
药物作用机制如何开展研究?
时间定格在2016年,你还在一个一个敲基因吗?

该醒醒啦!这年代不玩点儿高通量,都不好意思出门啊。

吉凯基因的全基因组Cas9文库筛选震撼来袭!
将CRISPR/Cas9载体文库包装成慢病毒
敲除文库包含122411种sgRNA靶点
其中19050种编码基因
1864种microRNA
过表达文库包含70290种SAM-sgRNA靶点
涵盖23430种编码基因转录本

即将火爆的毁灭性明星技术!
一网打尽目标药物的相关信号通路
收获大批耐药/增敏相关基因
抢先占领目的药物的研究制高点
抢发高分文章
基金申请不再愁
精准医疗的好基友
联合用药按图索骥
药效预期检测工具的开发神器


 
钢铁侠、美国队长式的单兵作战时代已经终结,人海战术的复仇者联盟时代降临!
我们的口号是:简单!粗暴!有效!
Cas9文库在手,高分文章我有!

先看Cas9文库应用的第一篇《Science》,2014年张峰用敲除文库对黑色素瘤细胞A375进行了感染,使用维罗非尼(Vemurafenib,一种BRAF抑制剂)进行药物筛选,发现了NF2、CUL3、TADA2B、TADA1等一系列未报道过的新型药物相关基因。至此,维罗非尼的药物机制研究已经被全盘承包,十年的工作,一年搞定。


 
2015年,张峰用同样的套路故技重施,发了一篇《Nature》,最主要区别是:文库由敲除库换成了过表达库。

全基因组Cas9文库筛选的原理并不复杂: 

  • 选定目标药物和细胞系
  • 将细胞感染Cas9慢病毒文库
  • 使每个细胞随机敲除/过表达某一个基因
  • 通过药物筛选及二代测序,得到增敏/耐药相关基因列表

全基因组Cas9文库筛选的主要实验操作步骤包括四阶段:

  • 预实验——摸索感染条件等
  • 文库筛选——高通量筛选耐药/增敏基因
  • 基因验证——验证相关基因的功能
  • 机制研究——讲故事,提升文章档次!

Cas9文库筛选是药物机制研究神器,但它不仅限于药物研究,一切能影响细胞生存、增殖的刺激因素皆可研究其背后的机制:致病病毒、缺氧、氧化压力、酸碱压力、温度、气压等。只要脑洞开得大,CNS不是梦!

(http://www.ebiotrade.com/)

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