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好尴尬!两家公司的液体活检结果差异明显
【字体: 大 中 小 】 时间:2017年12月21日 来源:生物通
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液体活检是一项新颖的非侵入性检测,有望取代肿瘤组织活检。通过检测在患者血液中循环的肿瘤DNA,这项技术有助于医生为患者定制最佳的治疗方案。不过,最近的结果让人有些尴尬:两位前列腺癌研究人员向两个不同的供应商提交相同的患者样本,但发现差异明显。
液体活检是一项新颖的非侵入性检测,有望取代肿瘤组织活检。通过检测在患者血液中循环的肿瘤DNA,这项技术有助于医生为患者定制最佳的治疗方案。不过,最近的结果让人有些尴尬:两位前列腺癌研究人员向两个不同的供应商提交相同的患者样本,但发现差异明显。
Gonzalo Torga和Kenneth Pienta博士是约翰•霍普金斯大学的研究人员。他们近日在《JAMA Oncology》上发文称,这些结果可能使癌症患者采取不同的治疗方案,具体要取决于他们采用哪一家液体活检供应商。
在此次研究中,他们比较的两个液体活检产品分别是Guardant Health的Guardant360,它测序73个基因的编码区;和Personal Genome Diagnostics公司的PlasmaSELECT,它测序64个基因的编码区。
这两家公司的产品在覆盖基因以及每个基因的区域上有所不同。在研究的40名患者中,只有25名在两家公司覆盖的重叠基因序列中至少报告了一个基因突变。
(图片来自原文)
即使采用同一次抽血的DNA来分析,这些患者的结果也很少能匹配。在比较重叠基因序列的结果时,只有7.5%的患者(3名)的突变检测结果完全匹配。对于15%的患者(6名),至少有一个突变结果匹配。而对于40%的患者(16名),两家公司均没有检测到突变。
研究人员的本意是寻找最好的商业实验室,来检测他们的转移性前列腺癌诊所的患者样本。“我们希望让患者做出最好的选择,所以我们同时向两个地方提交了样本,以比较结果,”Torga说。
众所周知,患者对癌症药物的反应可能有所不同,这取决于其肿瘤带有何种基因突变。肿瘤医生将根据液体活检的结果来看看患者是否对治疗有反应,是否需要更换或添加疗法。如果他们发现患者的肿瘤DNA带有特定突变,也可以根据这个来选择临床试验的患者。
Torga指出,每个商业化的检测大约花费4000美元,因此患者通常只将样本送到一个实验室进行检测。他认为液体活检是一项很有前途的技术,有望大大改变患者治疗,不过这也是一项新技术,可能需要更多的时间和经验才能改善。
作者表示,他们希望肿瘤医生意识到检测的不一致,而不要盲目相信液体活检的结果。(生物通 薄荷)
原文检索
Patient-Paired Sample Congruence Between 2 Commercial Liquid Biopsy Tests
JAMA Oncol. Published online December 14, 2017. doi:10.1001/jamaoncol.2017.4027