中科大最新《PNAS》文章

【字体: www.ebiotrade.com 时间:2018年1月2日 来源:中科大

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  研究人员阐明了蓝藻全局性转录因子NdhR通过结合不同的代谢小分子,快速响应环境变化,协同调控碳氮代谢的分子机制。

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中国科学技术大学微尺度物质科学国家研究中心和生命科学学院周丛照教授和陈宇星教授课题组与中国科学院武汉水生所张承才教授课题组合作,阐明了蓝藻全局性转录因子NdhR通过结合不同的代谢小分子,快速响应环境变化,协同调控碳氮代谢的分子机制。该研究成果以“Coordinating carbon and nitrogen metabolic signaling through the cyanobacterial global repressor NdhR”为题于2017年12月26日发表在美国科学院院刊《PNAS》上。

碳氮代谢是各种生物生存和生长所必须的,而微生物通过精细调控碳氮代谢平衡来适应不同的生长环境。蓝藻是地球上古老的自养光合生物,有些能够分化出异形胞进行固氮作用,因此是研究碳氮代谢的模式生物。正常情况下,光合作用的关键酶1,5-二磷酸核酮糖羧化酶/加氧酶RubisCO能够利用CO2生成3-磷酸甘油酸,并进入三羧酸循环生成alpha-酮戊二酸(2-OG),而2-OG可以作为碳骨架与氮源进一步合成氨基酸等重要分子。在CO2缺乏时,RubisCO则利用O2生成2-磷酸乙醇酸(2-PG)。因此2-OG和2-PG在蓝藻中的浓度是负相关的,二者可以作为碳氮平衡的指示剂。

在这篇文章,研究人员利用X-射线晶体学手段解析了蓝藻碳代谢全局性转录抑制子NdhR的三维结构,这是目前解析的第一个LysR家族转录抑制子全长蛋白的结构。通过大量的生化筛选,发现2-OG和2-PG分别是NdhR的协同抑制子和诱导子。

研究人员结合结构生物学、生物化学和微生物遗传学实验,发现蓝藻中氮浓度偏低时,2-OG浓度升高,NdhR与2-OG结合后与DNA启动子区域的亲和力增强,从而抑制碳转运相关基因的转录,以维持蓝藻内的碳氮平衡。当蓝藻内碳浓度偏低时,2-PG浓度升高,NdhR结合2-PG后构象发生变化,从启动子区域释放下来,其抑制子活性被解除,碳转运相关基因大量表达,进而实现碳氮平衡。

这一工作不仅阐明了LysR家族转录抑制子的一种全新调控机制,还揭示了蓝藻利用单个转录因子对代谢产物的响应来维持体内碳氮代谢平衡的分子机理,加深了我们对微生物代谢平衡的理解。

中国科大周丛照教授和陈宇星教授与中国科学院武汉水生所张承才教授为该论文的共同通讯作者。中国科大特任副研究员江永亮、已毕业的汪雪平博士和在读的博士生孙会为该论文的共同第一作者。分子动力学模拟部分的工作得到了中国科大生命科学学院张志勇教授的帮助,晶体数据收集在上海光源完成。该工作得到了国家自然科学基金委重点项目、中国科学院先导项目和科技部项目的资助。

原文标题:

Coordinating carbon and nitrogen metabolic signaling through the cyanobacterial global repressor NdhR

 


 

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