Cell杂志最受关注十篇文章(2月)

【字体: 时间:2017年02月21日 来源:生物通

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  第一篇论文由北京大学分子医学研究所,清华大学生命科学学院等处的研究人员联合完成:研究人员通过单粒子冷冻电子显微镜,获得了与非竞争性抑制剂glibenclamide构成复合物的一个异八聚体胰腺KATP通道的结构,其分辨率达到了5.6 Å。

  生物通报道:Cell创刊于1974年,现已成为世界自然科学研究领域最著名的期刊之一,并陆续发行了十几种姊妹刊,在各自专业领域里均占据着举足轻重的地位。Cell以发表具有重要意义的原创性科研报告为主,许多生命科学领域最重要的发现都发表在Cell上。本月《Cell》前十名下载论文为:

Structure of a Pancreatic ATP-Sensitive Potassium Channel

第一篇论文由北京大学分子医学研究所,清华大学生命科学学院等处的研究人员联合完成:研究人员通过单粒子冷冻电子显微镜,获得了与非竞争性抑制剂glibenclamide构成复合物的一个异八聚体胰腺KATP通道的结构,其分辨率达到了5.6 Å。格列本脲(glibenclamide)是一种降血糖药物,主要通过增加门静脉胰岛素水平或对肝脏直接作用,抑制肝糖原分解和糖原异生作用。

从这一结构中,研究人员发现了四个SUR1调节亚基定位在其周围,并且通过SUR1的TMD0-L0片段,结合在中心Kir6.2通道四聚体上。glibenclamide绑定的SUR1利用TMD0-L0片段稳定处于闭合构象的Kir6.2通道。此外在另一个结构中,磷脂酰肌醇4,5-二磷酸(PIP2)能将glibenclamide结合SUR1的Kir6.2通道解偶联。

这些结构研究指出了KATP通道的一条重要调控分子机制,即通过降血糖药物glibenclamide,细胞内腺苷核苷酸浓度以及PIP2脂质共同完成的调控分子机制。
清华北大两位教授联合发表Cell:ATP敏感性钾通道结构

Hallmarks of Cancer: The Next Generation

这篇综述性文章的重要性可从其长期占据榜单中窥见一斑:Weinberg教授继之前的癌症综述后,又发表了一篇升级版综述——Hallmarks of Cancer: The Next Generation,这篇同样也是与Douglas Hanahan合作的论文长达29页,简述了最近10年肿瘤学中的热点和进展,包括细胞自噬、肿瘤干细胞、肿瘤微环境等等,并且将原有的肿瘤细胞六大特征扩增到了十个,这十个特征分别是:

自给自足生长信号(Self-Sufficiency in Growth Signals);抗生长信号的不敏感(Insensitivity to Antigrowth Signals);抵抗细胞死亡(Resisting Cell Death);潜力无限的复制能力(Limitless Replicative Potential);持续的血管生成(Sustained Angiogenesis);组织浸润和转移(Tissue Invasion and Metastasis);避免免疫摧毁(Avoiding Immune Destruction);促进肿瘤的炎症(Tumor Promotion Inflammation); 细胞能量异常(Deregulating Cellular Energetics);基因组不稳定和突变(Genome Instability and Mutation)。

Therapeutic Targeting of MLL Degradation Pathways in MLL-Rearranged Leukemia

来自美国西北大学的研究人员发现了一种罕见的致死性儿童白血病的遗传促发因子,并找到了能用于阻止这种白血病癌细胞增殖的一种靶向分子疗法。过去二十年间,科学家们一直希望能了解这种罕见白血病的分子机制,最新研究在分子水平上提出了一种有效治疗方法,这对于治疗其它类型的癌症也具有重要意义。

目前大多数MLL相关研究主要集中在错误的11号染色体拷贝上,但是人体存在两个11号染色体拷贝,因此Shilatifard教授希望能分析野生型11号染色体。研究组成员发现儿童白血病的单个细胞中具有极低水平的由野生型MLL基因产生的蛋白质。由此他们提出,如果他们可以提高野生型MLL蛋白的水平,就能用以取代导致癌症发生的突变,从而治疗白血病。

研究人员经过细致的分子和生化筛查,发现了一种能维持野生型MLL温度,并干扰突变蛋白的化合物,为了验证这一发现,他们在培养物中培养混合性白血病细胞,并将其移植到小鼠中。然后他们将治疗化合物注射到小鼠中。结果发现野生型MLL恢复到了健康水平,也阻止了白血病细胞的迅速生长。目前这一组研究人员尝试合成更有效的化合物,希望能在芝加哥进行一项I期临床试验。

RNA Binding to CBP Stimulates Histone Acetylation and Transcription

增强子可提高附近的蛋白编码基因的基因表达率,所以细胞能够泵出更多所需的蛋白分子。一小部分神秘的非编码RNA,称为增强子RNAs(eRNAs)是从增强子序列转录而来的。虽然这些对于提高基因表达是非常重要的,但是它们是如何实现这一点的,仍然还是完全未知的。

一组研究人员通过揭示这些难以捉摸的eRNAs,发现CBP——激活来自增强子的转录的一种酶,可直接结合eRNAs。这种简单的行为通过调节乙酰化,来控制生物体内的基因表达模式,这种化学标记指导紧密包装在细胞核中的DNA解开,以促进转录。神秘的非编码RNA在基因表达中起重要作用

Human SRMAtlas: A Resource of Targeted Assays to Quantify the Complete Human Proteome

人类SRMAtlas是靶向识别及可重复性定量预测人类蛋白质组中所有蛋白的一些高度特异性质谱测定法的一个汇编目录,包括针对许多剪接变异体、非同义突变和翻译后修饰的检测方法。研究人员采用称作为选择性反应监测的技术,利用166,174个已充分确定特征的化学合成水解肽段(roteotypic peptides)开发出了这些检测方法。

这一SRMAtlas资源在http://www.srmatlas.org免费公开提供,将让一些重点、假设驱动及大型蛋白质组规模的研究获益。由于在理论上现在可以鉴别和定量任何样本中所有的蛋白质,研究人员预计这一资源将会大大推动基于蛋白质的实验生物学来了解疾病转变和健康轨迹。

Metastasis: Slipping Control

Cell杂志社高级编辑杨晓红(Xiaohong Helena Yang)博士早年毕业于中山大学,现任Cell出版社编务拓展顾问和Cancer Cell高级编辑。在最新一期(2月9日)Cell杂志上,她发表了题为“Metastasis: Slipping Control”的评述文章,以回忆录《坚韧》作者Elizabeth Edwards的话为引,介绍了近期癌转移研究的新进展。 杨晓红博士Cell发表癌症评述:癌转移的关键研究突破

Dynamic Remodeling of Membrane Composition Drives Cell Cycle through Primary Cilia Excision

我们的许多细胞都装备了一条毛茸茸的“天线”,将外部环境相关的信息传递给细胞,科学家们已经发现,这些所谓的原纤毛的出现和消失,都是与细胞复制过程(称为有丝分裂)同步的。现在,约翰霍普金斯大学的细胞生物学家报道称,他们进一步阐释了“这种‘脱发’和细胞复制,是如何通过戏剧性的纤毛尖端削剪(科学们称之为斩首)而相互关联的”。

这一新信息是更好地理解“细胞如何决定进行有丝分裂”的关键,这一过程对于生物体的发育、组织的维持和癌症的形成,是不可或缺的。他们也希望,这项工作能揭示纤毛相关疾病,如多囊肾病,以及某些智力残疾。

这项研究的负责人、约翰霍普金斯大学医学院细胞生物学副教授Takanari Inoue博士说:“纤毛斩首此前已经被观察过,但从未进行过探索。我们现在知道,这是一个正常的过程,而不仅仅是在一定的实验条件下发生的事情。我们已经确定了驱动它的分子机制。”

Spatiotemporal Control of Intracellular Phase Transitions Using Light-Activated optoDroplets

普林斯顿大学的科学家们开发出一种新的工具——被称为optoDroplet,给我们提供了前所未有的机会来操纵和理解允许无膜细胞器发挥功能的化学机制。

到目前为止,虽然大多数研究都使用试管中的纯化蛋白质,但是研究人员很少有方法来研究活细胞中的相变。optoDroplets将帮助科学家们了解“相变出错时,产生的固体状凝胶和蛋白质结晶聚集体会引发某些疾病(包括阿尔茨海默氏症和ALS)”的更多信息。

optoDroplet依靠光遗传学技术,涉及的蛋白质其行为可以通过光照改变。(细胞大多是水,基本上是透明的。)研究人员发现,他们可以通过打开光激活的蛋白质,诱导相变和制备无膜细胞器。他们也可以通过简单地把光关掉而取消相变。增加光强度和蛋白质浓度,可允许研究人员进一步控制相变。阐明活细胞中蛋白质凝缩的新工具

(生物通:万纹)

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