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PacBio新型测序仪升级 2017年中国订单拉升
【字体: 大 中 小 】 时间:2017年02月07日 来源:生物通
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Pacific Biosciences公司首席执行官Mike Hunkapiller今年2月3日表示,本周PacBio的Sequel单分子测序仪的订单需求增多,同时近期公司将升级Sequel系统,提供新型试剂和软件装备,计划于2017年年底前完成Sequel通量翻倍。
生物通报道:Pacific Biosciences公司首席执行官Mike Hunkapiller今年2月3日表示,本周PacBio的Sequel单分子测序仪的订单需求增多,同时近期公司将升级Sequel系统,提供新型试剂和软件装备,计划于2017年年底前完成Sequel通量翻倍。
同时Hunkapiller表示,2016年第四季度PacBio的业绩并未受到罗氏近期终止的诊断开发协议的影响,今后PacBio将会直接与对PacBio技术感兴趣的临床实验室合作。
“我们从这一领域几乎普遍得到积极的回应,”他说。而且一些回应已经变成了仪器订单,其中国内测序服务供应商 Novogene 和 GrandOmics 分别于去年第四季度和今年的1月向PacBio订购了5台和10台Sequel仪器,国内的精准医疗项目催生了相应的需求。
Hunkapiller认为来自GrandOmics的订单更是PacBio测序系统受到认可的一种标志,因为去年早期GrandOmics曾订购过一台合作仪器,“我们完成了他们需要的主要程序处理,从头组装,立即GrandOmics就又加订了5台测序仪。现在大家都开始愿意下数百万美元的订单了”。
他相信这其中部分原因在于Sequel系统的升级,并且他也表示今年PacBio还将进行更进一步的升级。
去年第四季度,PacBio提高了Sequel的上样效率,帮助研究人员加载长片段测序文库,这是从头组装测序的关键所在。上周Hunkapiller表示,PacBio将推出新的化学试剂和软件,这一试剂可以根据样品类型和制备方法,以及研究需求,实现一个SMRT的8千兆碱基(gigabases)数据,和超过20K碱基的N50读长,而且长基因组文库也增加到80K。
到今年年底,PacBio也将实现Sequel通量翻倍,这通过增加零模波导孔(zero-mode waveguides, ZMWs)数量来完成,每个ZMW都能够包含一个DNA聚合酶及一条不同的DNA样品链。每次运行能够平行检测大约75,000个单分子测序反应。
同时PacBio也开始使用新版的SMRT单元,这将比现有的芯片扩增8倍的容量(增加芯片上的ZMW数量),新版SMRT将在今年年底开始使用。在接下来的两年里,PacBio的目标是将通量提高8到16倍。
Hunkapiller指出增加Sequel的通量有助于拓宽应用范围,扩大相应产品的市场。目前agbio客户以及对从头组装和结构变异检测感兴趣的客户越来越多,“我们的技术为植物和动物研究和研发提供了必要条件”,Hunkapiller说。
去年12月,罗氏终止了与PacBio关于开发商业化临床诊断测序仪器的协议。罗氏打翻友谊的小船,PacBio重获进军临床机会
Hunkapiller表示,虽然这一决定有些令人惊讶,但考虑到PacBio已经完成了与罗氏的所有里程碑合作,这对PacBio实际上产生的是“中立”的影响。此前PacBio曾预测罗氏将成为其最大的客户之一,但预测时间是从今年下半年开始,在此之前PacBio并没有指望罗氏。此外,协议终止也将令PacBio可以与潜在的临床客户直接合作,此前根据协议,如果客户希望使用Sequel进行临床研究,将需要与罗氏合作。
目前PacBio已经陆续接到了一些订单,Hunkapiller表示,PacBio将开始积累各方面经验,未来也许会寻求与区域经销商合作,更好地解决临床市场的特殊需求。
(生物通:张迪)