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Illumina 靶向测序定制Panel 服务全线开放
【字体: 大 中 小 】 时间:2017年04月28日 来源:Illumina
编辑推荐:
Illumina 针对广大客户的需求,在固定内容的试剂盒或靶向集合之外,另推出Panel 定制服务。仅需提供目标区域,即可经由自助在线定制工具或Illumina专业设计服务,获得个性化的定制Panel。
靶向测序介绍:
靶向测序,即捕获或扩增部分基因或基因组区域并进行测序的技术。靶向测序可降低测序成本、减少所需时间、减轻数据分析量,帮助广大客户将资源与精力集中于感兴趣的区域。
Illumina 针对广大客户的需求,在固定内容的试剂盒或靶向集合之外,另推出Panel 定制服务。仅需提供目标区域,即可经由自助在线定制工具或Illumina专业设计服务,获得个性化的定制Panel。
图1 靶向测序的适用领域
捕获技术介绍:
Illumina 提供TSCA (TruSeq Custom Amplicon) 和NRCC (Nextera Rapid Capture Custom) 两种靶向建库技术。
1. TSCA是一种多重扩增子技术,其建库过程如图2,其中的Low Input版本具有以下特点:
1) DNA 起始量要求低,可低至10ng。
2) 操作简单快速,仅需6.5h 即可完成建库。
3) 适用于福尔马林固定石蜡包埋(FFPE) 样品。
4) 与双链测序兼容,可避免因福尔马林固定过程中的脱氨基而引起的C/T假阳性。
2. NRCC是基于杂交的探针捕获技术,其建库过程如图3, 具有以下特点:
1) 适用于较多基因较大内容的Panel(例如 >0.5 Mb的靶向内容)
2) 可以检测拷贝数变异、未知基因融合
3) 用转座酶打断 DNA,无需Covaris 核酸打断仪
4) DNA 起始量要求(50ng) 大大低于其他同类产品
表1 TSCA 及NRCC 的参数及表现
TSCA (Low Input) |
||
Panel 大小 |
4–650 kb |
0.5–15Mb |
最低起定量 |
16 samples |
48 samples |
最低起始DNA 量 |
10 ng DNA |
50 ng DNA |
靶向建库方法 |
Amplicon |
Enrichment |
FFPE 兼容性 |
Yes |
No |
图2 TSCA 建库过程
图3 NRCC 建库过程
Illumina 客户定制Panel 服务
Illumina 提供两种Panel定制服务类型:1)自助在线设计 和 2)一站式设计、验证、优化、分析服务。
1. 自助在线设计工具DesignStudio: designstudio.illumina.com,其主要功能:
1) DNA, RNA Expression, RNA Fusion Panel 设计。
2) 可以根据Panel 的大小,选择TSCA 或NRCC 技术。
3) 支持多种物种。
4) 在线自助设计,免费设计,全面的技术支持。
5) 自主知识产权,Panel 产权归客户所有。
6) 不提供实验验证。
图4 DesignStudio 使用界面
2. Concierge 服务:一站式服务,提供设计、实验验证、Panel优化、分析服务,客户提供目标基因/热点/区域,Illumina 研发团队进行研发。Illumina提供的服务有:
1) 个性化Panel 设计
2) 实验验证Panel 的效果
3) Panel优化,根据实验结果对Panel进行优化
4) 提供Panel配套的生物信息服务
图5 Concierge 提供设计,验证,生信服务
技术支持及联系方式:
技术支持热线:400 635 9898, techsupport@illumina.com
或者联系本地销售,获取更加优质的服务。
欲了解更多信息,欢迎访问:https://www.illumina.com.cn/informatics/research/experimental-design/designstudio.html