Illumina 靶向测序定制Panel 服务全线开放

【字体: 时间:2017年04月28日 来源:Illumina

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  Illumina 针对广大客户的需求,在固定内容的试剂盒或靶向集合之外,另推出Panel 定制服务。仅需提供目标区域,即可经由自助在线定制工具或Illumina专业设计服务,获得个性化的定制Panel。

靶向测序介绍:

靶向测序,即捕获或扩增部分基因或基因组区域并进行测序的技术。靶向测序可降低测序成本、减少所需时间、减轻数据分析量,帮助广大客户将资源与精力集中于感兴趣的区域。

Illumina 针对广大客户的需求,在固定内容的试剂盒或靶向集合之外,另推出Panel 定制服务。仅需提供目标区域,即可经由自助在线定制工具或Illumina专业设计服务,获得个性化的定制Panel。


 
图1 靶向测序的适用领域

捕获技术介绍:

Illumina 提供TSCA (TruSeq Custom Amplicon) 和NRCC (Nextera Rapid Capture Custom) 两种靶向建库技术。

1. TSCA是一种多重扩增子技术,其建库过程如图2,其中的Low Input版本具有以下特点:
1) DNA 起始量要求低,可低至10ng。
2) 操作简单快速,仅需6.5h 即可完成建库。
3) 适用于福尔马林固定石蜡包埋(FFPE) 样品。
4) 与双链测序兼容,可避免因福尔马林固定过程中的脱氨基而引起的C/T假阳性。

2. NRCC是基于杂交的探针捕获技术,其建库过程如图3, 具有以下特点:
1) 适用于较多基因较大内容的Panel(例如 >0.5 Mb的靶向内容)
2) 可以检测拷贝数变异、未知基因融合
3) 用转座酶打断 DNA,无需Covaris 核酸打断仪
4) DNA 起始量要求(50ng) 大大低于其他同类产品

表1 TSCA 及NRCC 的参数及表现

TSCA (Low Input)

NRCC

Panel 大小

4–650 kb

0.5–15Mb

最低起定量

16 samples

48 samples

最低起始DNA

10 ng DNA

50 ng DNA

靶向建库方法

Amplicon

Enrichment

FFPE 兼容性

Yes

No


图2    TSCA 建库过程

图3 NRCC 建库过程

Illumina 客户定制Panel 服务

Illumina 提供两种Panel定制服务类型:1)自助在线设计 和 2)一站式设计、验证、优化、分析服务。

1. 自助在线设计工具DesignStudio: designstudio.illumina.com,其主要功能:

1) DNA, RNA Expression, RNA Fusion Panel 设计。
2) 可以根据Panel 的大小,选择TSCA 或NRCC 技术。
3) 支持多种物种。
4) 在线自助设计,免费设计,全面的技术支持。
5) 自主知识产权,Panel 产权归客户所有。
6) 不提供实验验证。


 
图4 DesignStudio 使用界面

2. Concierge 服务:一站式服务,提供设计、实验验证、Panel优化、分析服务,客户提供目标基因/热点/区域,Illumina 研发团队进行研发。Illumina提供的服务有:

1) 个性化Panel 设计
2) 实验验证Panel 的效果
3) Panel优化,根据实验结果对Panel进行优化
4) 提供Panel配套的生物信息服务

 

图5 Concierge 提供设计,验证,生信服务

技术支持及联系方式:
技术支持热线:400 635 9898,
techsupport@illumina.com
或者联系本地销售,获取更加优质的服务。

欢迎咨询Illumina的靶向测序定制Panel服务

欲了解更多信息,欢迎访问:https://www.illumina.com.cn/informatics/research/experimental-design/designstudio.html

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