山大齐鲁医院：ceRNA网络分析及MELAS与线粒体DNA突变的潜在生物标志物研究

　　

目前已经鉴定了引起线粒体疾病的许多病原性mtDNA突变，如最常见的mtDNA A3243G突变，其被广泛认可的表型是MELAS综合征。尽管关于线粒体疾病的研究越来越频繁，但许多潜在的发病机制尚未完全被发现。改进线粒体表观遗传学对线粒体功能障碍的认识有助于深入了解线粒体疾病的发病机制，发现新的生物标志物，产生新的治疗策略。

在这项研究中，山东大学齐鲁医院焉传祝主任医师研究团队利用microRNA芯片及LncRNA 测序技术对线粒体肌病、脑病、乳酸性酸中毒和中风样发作（MELAS）中线粒体DNA（mtDNA）A3243G突变的调控网络进行了分析，以期了解粒体肌病的发病机制。

利用高通量测序技术及后续进行的qRT-PCR）以及生物信息学分析发现，20例mtDNA A3243G突变的MELAS患者和20个正常对照组之间失调肌肉中miRNAs和lncRNAs形成了一个复杂的调控网络，并且这些miRNA及lncRNA形成的调控网络也参与发现和训练阶段的免疫系统、信号转导、翻译、肌肉收缩等通路。对选中的肌肉和血清中的ncRNA进行了qRT-PCR验证。ROC曲线分析结果显示，血清miR-27b-3p降低比乳酸盐具有更高的诊断价值，miR-27b-3p可作为MELAS的新型非侵入性生物标志物。后续的深入研究将有助于更好地了解ncRNA在线粒体肌病发病机制中的作用。

 
图 基于MELAS诊断和与临床参数相关的MiR-27b-3p的生物标志物

（A）鉴别MELAS患者与对照组肌肉生物活性的6种miRNA的ROC曲线
（B）鉴别MELAS患者与对照组肌肉生物活性的5种lncRNA的ROC曲线
（C）MELAS患者血清和肌肉中miR-27b-3p减少
（D）相比于MELAS患者，显示出更高的乳酸盐诊断准确度。
（E）血清miR-27b-3p水平与乳酸之间存在显著相关性
（F）血清miR-27b-3p水平与NMDAS之间存在显著相关性
（G）血清miR-27b-3p水平与肌肉中A3243G突变负荷之间存在显著相关性

用户文章
Wang W, et al.(2017) Identifcation of miRNA, lncRNA and mRNA-associated ceRNA networks and potential biomarker for MELAS with mitochondrial DNA A3243G mutation. Scientific RepoRts. DOI: 10.1038/srep41639

本研究中的microRNA芯片及LncRNA 测序由联川生物提供

联川生物为研究人员提供从miRNA鉴定到调控靶基因功能分析的一站式解决方案

获取更多用户研究案例，请访问www.lc-bio.com或拨打咨询热线0571-87662413
 
关于联川生物
联川生物成立于2006年，经过多年的快速发展，已成为业界领先的多组学技术服务商。公司拥有具有自主知识产权的µParaflo®微流体定制化芯片平台，可以为科研用户提供从基因组，转录组，到蛋白组的高通量定制化表达谱芯片解决方案。我们是全球首家提供microRNA表达谱芯片分析的服务商。作为国内最早提供高通量测序技术服务的公司之一，联川生物拥有经验丰富的技术团队和一流的生物信息学专家组，可以为研究人员提供多组学测序服务和深度个性化数据分析解决方案。为满足研究人员跨组学高通量研究需求，联川生物已将蛋白质组定量分析引入技术服务线，为用户提供贯穿中心法则的全程解决方案。多年来，联川生物一直与国内的科研团队保持着长期紧密的合作，助力科研人员在生物、医学、和农林领域的科学发现。全球科研用户使用联川生物的优质科研服务和高质量组学实验数据已发表了逾600篇高水平研究论文，其中已在Cell，Nature，Science系列顶级期刊上发表论文22篇。