南京农大,中国农业科学院Nature Genetics发表全基因组重测序新发现

【字体: 时间:2017年06月14日 来源:生物通

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  来自南京农业大学,中国农业科学院棉花研究所,浙江大学等处的研究人员发表了题为“Genomic analyses in cotton identify signatures of selection and loci associated with fiber quality and yield traits”的文章,通过基因组分析发现了棉花品种改良特性、鉴定出纤维品质和产量性状关联位点。

  

生物通报道:来自南京农业大学,中国农业科学院棉花研究所,浙江大学等处的研究人员发表了题为“Genomic analyses in cotton identify signatures of selection and loci associated with fiber quality and yield traits”的文章,通过基因组分析发现了棉花品种改良特性、鉴定出纤维品质和产量性状关联位点。

这一研究成果公布在6月5日的Nature Genetics杂志上,文章的通讯作者分别为南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室张天真教授,以及中国农科院棉花研究所杜雄明研究员。据报道这是南京农业大学首次在Nature Genetics杂志上发表论文。

棉花纤维是重要的天然纺织纤维,在国民经济中占据着重要地位。中国约有2000年的棉花种植历史,是世界三大产棉国之一。中国的陆地棉栽培始于20世纪初,主要从美国引种。但中国的陆地棉遗传资源狭窄,同质性较高,使得遗传育种工作遇到了瓶颈。

此前,张天真教授研究组与德州大学等处合作,通过将美国陆地棉与野生棉对比,首次绘制出棉花表观遗传基因的“甲基化基因图谱”,分析了野生棉和种植棉之间500多种表观遗传基因的差异。

在最新这篇文章中,研究人员进一步通过对318份棉花的全基因组重测序,揭示了从美棉品种改良为全球最大纤维作物的遗传基础和演化规律,鉴定出25个品种改良相关位点和119个产量、纤维品质、黄萎病抗性等关联位点。

其中尤为值得关注的是,研究人员鉴定出能同时提高2-3个产量性状或纤维品质性状的关联基因,为棉花“精准育种”提供了优异的基因资源和理论指导,有非常重要的利用价值。

此外,今年3月,华中农业大学的研究人员从全世界主要棉区收集了31份陆地棉野生种和321份驯化种进行基因组重测序研究。利用这些数据,他们构建了陆地棉的首个综合变异图谱,包括单碱基多态性(SNP),插入/缺失(InDel)和结构变异(SV)。这一结果通过公布在Nature Genetics杂志上。华中农业大学Nature Genetics发表基因组研究新进展

原文标题:

Genomic analyses in cotton identify signatures of selection and loci associated with fiber quality and yield traits

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