安诺Hi-C新突破,开启2018新篇章

【字体: 时间:2018年01月10日 来源:安诺基因

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  2017年安诺Hi-C技术在建库、测序、分析各个环节全面升级,不断创新,突破重要技术瓶颈,实现了测序数据量大幅减少、建库成功率和有效数据利用率大幅提升、多组学联合分析内容全方位完善等重大技术进展。

  

安诺基因作为三维基因组学测序技术的引领者,一直不断改进Hi-C测序技术,完善Hi-C分析内容,致力于为广大科研工作者提供最优质、性价比最高的Hi-C测序服务。2017年安诺Hi-C技术在建库、测序、分析各个环节全面升级,不断创新,突破重要技术瓶颈,实现了测序数据量大幅减少、建库成功率和有效数据利用率大幅提升、多组学联合分析内容全方位完善等重大技术进展。秉承引领技术发展的承诺,安诺Hi-C始终不忘初心,砥砺前行!

1. 测序数据量大幅减少

依据目前所有的Hi-C高水平论文和安诺基因自身的项目经验,依据分辨率和基因组大小等参数,安诺基因Hi-C研发团队推出科学的测序数据量计算公式,并通过提高单个文库的数据量产出,大幅减少了Hi-C所需测序数据量和文库数量,从而大幅降低了Hi-C测序的成本,使得Hi-C技术可以为更多的科研工作者服务。

表1  Hi-C测序数据量比较(部分物种)

2. 建库成功率和有效数据利用率大幅提高

Hi-C技术的一大技术难点在于高水平文库的构建和有效数据的高利用率,为此安诺Hi-C设置了最严格的文库质控标准和数据质控流程(表2、表3),获得了更为优质的Hi-C数据(表4),部分物种的valid paired-end reads比例已超过CNS文章水平。

表2  安诺基因Hi-C测序文库质控标准

表3 安诺基因Hi-C数据过滤质控步骤


 
表4  安诺Hi-C建库经验数据

3. 信息分析内容升级

安诺基因在对Hi-C测序流程实行严格质控的基础上,同时对分析内容同时进行了全面升级,实现并完善了Hi-C与WGS、GWAS、RNA-seq及ChIP-seq等多组学数据关联的个性化分析内容,从基因表达调控、表观遗传调控等不同维度来阐释生物学事件的相关机制。


 
图1  Hi-C多组学关联分析路线图

4 . Hi-C合作文章同步见刊

2017年,安诺基因合作发表的文章“The Tartary Buckwheat Genome Provides Insights into Rutin Biosynthesis and Abiotic Stress Tolerance”见刊Molecular Plant,参与苦荞基因组测序中的Hi-C研究部分,揭示了苦荞的天然产物芦丁的生物合成及耐逆机制,对指导苦荞的遗传育种与种质资源利用具有重要的意义。至此,安诺Hi-C合作发表文章累积影响因子达73.236,平均影响因子14.647。

表5  安诺Hi-C合作发表文章

深入了解安诺基因的Hi-C测序技术

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