官宣:PacBio 试剂软件再次升级!

【字体: 时间:2018年10月19日 来源:基因有限公司

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  PacBio 官方在10月10日正式公开发布升级版PacBio Sequel 软件(V6.0 软件)、配套测序试剂耗材也升级至V3.0版本。此次升级PacBio Sequel系统的准确度、通量及读长均有所提升。

PacBio 官方在10月10日正式公开发布升级版PacBio Sequel 软件(V6.0 软件)、配套测序试剂耗材也升级至V3.0版本。此次升级PacBio Sequel系统的准确度、通量及读长均有所提升。这一可喜的进步使得PacBio SMRT测序在de novo组装、结构变异检测、靶向测序以及RNA Iso-Seq测序等方面的应用更具优势。

具体升级表现:

1. 参数表现

经过此次升级,应用最新版本的V3.0试剂及V6.0软件进行实验。采用10 hr的测序芯片进行全基因组测序时,一张测序芯片最高可产20Gb数据量,最长平均酶读长可达30 kb;采用20 hr的测序芯片进行小片段扩增子测序时,一张测序芯片最高可产50Gb 数据,最长平均酶读长可达100 kb。

除了测序系统硬件下机数据各项参数指标提升外,官方还对软件进行了升级,增加碱基识别的准确性,加强了结构变异分析功能,可检测>20bp的结构变异(5.1的系统为>50bp 的结构变异),提升了软件分析的速度。

2. 实测数据

Human WGS:35 kb insert; 20 hr movie

 

Short Insert : 10/20 hr movie; Q20/30

  

此次升级每张测序芯片通量较2011年首次商业化相比提高了2,000倍。通量的不断提升为人类医学、动植物科学研究项目节省了大量成本,使研究人员有机会扩大项目的规模。

PacBio CEO Michael Hunkapiller 博士说道:“此次试剂和软件双双升级对系统的各性能参数包括测序准确度、通量和测序读长均有所提升。客户现在可以通过长读长测序技术进行高准确度的单分子读取,无需在读长和准确度之间进行权衡,因为现在可以实现长达15kb 且准确度与Sanger相媲美的碱基序列。”

PacBio CSO Jonas Korlach 博士补充道:“此次升级为全面地研究人类基因中各种遗传变异,无论是SNVs,还是indel,又或者是SVs,都提供新的机会,并为大规模人群研究,高质量人类基因组研究的新时代铺平了道路。”

基因有限公司作为PacBio公司在中国区的独家代理商,自2011年以来将PacBio第三代单分子实时测序技术引入国内,一直为国内用户提供专业的三代测序系统的安装培训,技术支持,应用培训与售后维护工作,赢得客户的一致好评与信任。基因有限公司将一如既往的支持越来越多的PacBio用户。

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