生物分子直接相互作用新型检测方法

【字体: 时间:2018年10月30日 来源:生物通

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  Nature Communications杂志报道了来自基因组调控中心(CRG)开发的一项新技术(被称为rec-YnH),这项技术旨在了解数百个蛋白质和RNAs同时形成的复合物。

  

蛋白质是细胞构建模块。它们对细胞、身体组织和器官的结构、功能和动态调节是必不可少的。蛋白质很少单独作用,它们相互作用,形成蛋白质复合体或结合DNA和RNA来控制细胞的功能。

这些复合物是细胞内许多重要反应的关键部分,如能量代谢或基因调控。相互作用中的任何变化,例如可能由突变引起,都会在健康和疾病之间产生差异。因此,为了理解细胞如何运作,或者病态细胞中可能出现什么问题,了解它们的结构模块(蛋白质)如何相互作用是至关重要的。

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在过去的几十年里,新技术使科学家能够理解生物拥有的遗传信息,这些信息中的哪些是被积极使用的,哪些是由细胞在不同环境下产生的蛋白质。现在,理解生物分子如蛋白质和RNA信使分子如何结合形成功能细胞所需的复合物是一个巨大的挑战。换句话说,我们知道一个细胞是由成千上万个零件组建起来的,但是我们不知道它们是如何结合在一起的。

Nature Communications杂志报道了来自基因组调控中心(CRG)开发的一项新技术(被称为rec-YnH),这项技术旨在了解数百个蛋白质和RNAs同时形成的复合物。

这项技术由 Sebastian Maurer和Luis Serrano联合领导开发,是首款可以同时检测大量蛋白质和RNA分子之间相互作用的技术。研究者们致力于开发一种可靠且经济实惠的方法。

“我们的方法可以稳定地测量许多蛋白质或许多蛋白质和RNA片段之间的相互作用,而不需要昂贵、专门设备,”Sebastian Maurer解释说。“这种方法可用于任何标准生物医学研究实验室,对于研究细胞中的特定过程是有用的,对于每次必须探索数百万个蛋白质相互作用以寻找与特定疾病有关的复合物的研究人员来说,也非常实用。”

两个CRG实验室成功地整合了他们在生物信息学、生物化学和分子生物学方面的专业知识来实施和验证该方法。“我们的合作创造了一种负担得起的、可行的方法,可以产生高质量的蛋白质-蛋白质和蛋白质-RNA相互作用图谱,” 该文章的共同第一作者,博士后Jae-Seong Yang说。

“蛋白质和RNA之间的相互作用是许多生物学过程的关键,包括基因调控,我们的方法是第一个可以同时检测数百种蛋白质和RNA之间相互作用的方法。有这样一个高效的新工具,将有助于回答与许多疾病有关的重要问题,” CRG 研究人员,该文章的共同第一作者 Mireia Garriga说。

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原文检索:rec-YnH enables simultaneous many-by-many detection of direct protein–protein and protein–RNA interactions

(生物通:伍松)

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