绘测人类癌症的染色质形貌

　　

通过对人类原发性癌症的基本未知的染色质形貌进行绘测，研究人员对不同癌症相关基因的调控有了新的了解。这项研究为寻求了解跨越一系列癌症类型调控动态的科研人员提供了宝贵的资源，它可能会在某一天对划分癌症患者群而令每一群体得到更有效的治疗提供帮助。

癌症是一种高度多样化的疾病群，其特征是存在着许多不同类型的肿瘤、临床特性、患者转归及治疗反应。通过大规模的基因组与分子学分析，《癌症基因组图谱》（The Cancer Genome Atlas，或TCGA）记录了许多造成癌症的基因突变。

然而，尽管可公开得到的TCGA数据记录收集了丰富的有关人类癌症的基因组信息，但一种更加系统的对DNA-蛋白复合物的调查（基因就见于该被称作染色质的复合物质中）或能以影响癌症预后和治疗的方式帮助更好地在影响不同癌症相关基因的开关中插入楔子。一个近来在研究可及性染色质中所取得的进展被称作ATAC-seq，它是由斯坦福大学的科研人员（包括那些参与这项新研究的人）研发的，它能在少量样本中进行染色质的综合分析。ATAC-seq用一种酶来揭示染色质的可及片段，这转而能披露DNA的活性调控成分。

M.Ryan Corces和同事在此用ATAC-seq来绘测23种人类原发性癌症的染色质可及性形貌，所用的是由TCGA衍生的410个样本。通过识别超过50万个可及DNA成分，Corces等大幅扩展了癌症基因组已知DNA调控成分的范畴。他们的研究为癌症的遗传风险基因座提供了新的线索。据作者披露，这项研究的结果还提示，需要有一种系统性了解癌症非编码基因组学的方法以真正地推进对癌症疾病的有效诊断和治疗。

在一篇相关的《视角》中，Jussi Taipale写道：“鉴于该数据集的规模和其多生物组学特征，要在其中做出新的发现具有很大的潜力。”