Bio-Rad推出scATAC-Seq的早期试用计划

【字体: 时间:2018年10月10日 来源:生物通

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  染色质开放性分析(ATAC-Seq)近年来已成为表观基因组学研究领域的新宠,在各种杂志上频繁亮相。为此,Bio-Rad公司近日向早期试用客户推出scATAC-Seq解决方案,即单细胞版本的ATAC-Seq。

染色质开放性分析(ATAC-Seq)近年来已成为表观基因组学研究领域的新宠,在各种杂志上频繁亮相。为此,Bio-Rad公司近日向早期试用客户推出scATAC-Seq解决方案,即单细胞版本的ATAC-Seq。

此方案利用Bio-Rad的ddSEQ单细胞微滴制备系统,将数千个细胞核包在纳升大小的微滴中开展文库制备。这种表观基因组学方案以单细胞分辨率实现了全基因组范围的开放染色质测序。

ATAC-Seq是通过改造后的Tn5转座酶介导,对染色质结构的开放区域进行捕获测序,仅需少量细胞便可获得全基因组的活性调控序列信息,广泛应用于转录因子结合分析、核小体定位、活性调控元件分布等研究。

与现有的其他方法相比,ATAC-Seq操作过程简单,建库步骤简化,样本起始量也大大降低。Bio-Rad的scATAC-Seq方案让早期试用客户能够研究稀有细胞群体,从而开辟新颖的应用,如研究肿瘤异质性或鉴定血液中的稀有细胞。

这种方案实现了单细胞水平上的全基因组范围开放染色质测序。它利用ddSEQ单细胞微滴制备系统来分离数千个细胞核,将每个包裹在纳升大小的微滴中。同时,此方案采用了活性极高的转座酶,将核小体之间的链切割成很短的片段,带来更高的分辨率。

此外,凭借其在微滴方面的专长,Bio-Rad也带来了一个高通量的解决方案。ddSEQ单细胞微滴制备技术每次可处理数千个细胞,每天可处理数万个细胞,而微孔板技术每次只能处理96个细胞。这种通量让研究人员能够更深层地研究免疫细胞和癌细胞。

Bio-Rad数字生物学部门的产品经理Dan Norton表示:“独特的scATAC-Seq方案让研究人员能够更深层地了解细胞命运的机制,鉴定异质组织中存在的细胞类型,以及验证单细胞基因表达数据。”

目前,Bio-Rad正在招募实验室来试用这个最新推出的scATAC-Seq方案。如果您有意加入这个早期试用计划,可以联系一下Bio-Rad。(生物通 薄荷)

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