QIAGEN宣布RNA测序文库制备的新突破

【字体: 时间:2018年11月05日 来源:生物通

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  这一突破的秘诀就在于QIAseq FastSelect RNA Removal Kit,它让科学家能够从RNA-seq文库中快速去除与研究无关的RNA种类。

QIAGEN公司近日宣布一项突破性技术,能够在RNA测序之前更快速、更简便地制备文库。这一突破的秘诀就在于QIAseq FastSelect RNA Removal Kit,它让科学家能够从RNA-seq文库中快速去除与研究无关的RNA种类。

在RNA中,核糖体RNA(rRNA)的丰度最高,占到总RNA的80%以上。这些rRNA所含的转录组信息很少,浪费了宝贵的测序资源,也让特定类型RNA的检测变得困难。同样,在对血液样本进行RNA测序时,珠蛋白(globin)mRNA也产生了无任何价值的数据。

于是,这些无关RNA的去除就显得格外重要。目前,相关的RNA去除方法基本上都是采用基于杂交捕获的磁珠纯化或通过特定酶消化来完成。不过,它们通常需要若干个手动操作步骤,而且需要2小时以上才能完成,大大降低了文库制备的效率。

QIAseq FastSelect RNA Removal Kit仅需通过简单的1步加样操作以及随后的程序性降温孵育,无需任何额外纯化步骤,便可在20分钟内将样品中99%以上的rRNA和/或珠蛋白mRNA高效去除。

目前,这个试剂盒可与市售的大多数链特异性RNA文库制备方案兼容,并支持来自FFPE、血清血浆、外泌体等特殊降解样品中的总RNA,样品起始量低至1 ng,有助于实现更加精准的测序。

“QIAseq FastSelect RNA Removal Kit可从任何样品中选择性地快速去除RNA种类,甚至是最困难的FFPE样品,让研究人员能够获得高质量,可重复的RNA测序结果,同时最大限度地减少时间和成本,”QIAGEN生命科学业务部门高级副总裁Thomas Schweins博士如是说。

“这个试剂盒可以在一个简单的工作流程中完成当前的文库制备方案在30多个步骤中才实现的目标。通过使用一系列专有的新技术,QIAseq FastSelect RNA Removal Kit从根本上简化并加速了RNA的去除。我们提供去除rRNA或珠蛋白mRNA的现成产品,也可以设计定制的RNA去除方案,”他补充说。

如今,QIAGEN的RNA-seq产品组合正在不断扩大,除了最新推出的产品之外,还有适用于单细胞或低起始量样品的QIAseq UPX 3’ Transcriptome/Targeted RNAseq Kit,适用于小RNA测序的QIAseq miRNA Library Kit,以新颖快速的流程实现链特异性RNA测序的QIAseq Stranded Library Kit,以及适用于T细胞受体克隆分型的QIAseq Immune Repertoire kit。(生物通 薄荷)

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