Science子刊公布癌症液体活检重要成果:评估肿瘤DNA片段的大小!

【字体: 时间:2018年11月09日 来源:生物通

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  液体活检已经成为了癌症检测的一大热门词汇,许多液体活检都是通过循环肿瘤DNA(ctDNA)进行检测,ctDNA就是肿瘤细胞遗传物质脱落后进入血液的碎片。

  

生物通报道:液体活检已经成为了癌症检测的一大热门词汇,许多液体活检都是通过循环肿瘤DNA(ctDNA)进行检测,ctDNA就是肿瘤细胞遗传物质脱落后进入血液的碎片。

来自剑桥大学的科学家们建立了一种新方法,通过分析ctDNA的大小,在血液中检测难以追踪的肿瘤DNA(又称ctDNA),这种方法可提高对罹患脑癌、肾癌、胰腺癌患者ctDNA的检测能力。

这一研究成果公布在11月7日的Science Translational Medicine杂志上,由剑桥大学英国剑桥癌症研究所的Nitzan Rosenfeld博士领导完成。同期Science Translational Medicine杂志配发了评论性文章。

ctDNA这种活检方式比其他的癌症检测方法具有潜在的优势,因为首先它是微创的,可以在治疗期间随时进行,从而医生可以实时监测肿瘤的分子变化。而且这不会因为成像的不确定性而发生误判,最后ctDNA也可能代表了患者整体的肿瘤状况,而不仅仅是局限于受检测部分的肿瘤。

但是,ctDNA难以确认,因为它通常在数量上远远少于更大数量的也在血液中循环的非癌DNA。以往的研究已经证明,血液循环中来自胎儿的DNA片段因为较短而能与母亲的DNA区分开来,这一发现帮助提高了产前诊断的敏感性。

在这篇文章中,研究人员设计了一种新的方法,考虑的是ctDNA的大小、片段差异,而不是ctDNA的基因组改变。他们利用全基因组测序来检查来自200名癌症患者的344个血浆样本中的ctDNA片段的大小。

结果发现了与每个患者癌症类型相关的ctDNA生物学特征,研发了用于选择特定ctDNA片段大小的计算方法。研究人员发现,长度在90-150碱基对之间的ctDNA片段可提高对罹患脑癌、肾癌、胰腺癌患者ctDNA的检测能力。

Rosenfeld博士指出,这种通过对ctDNA大小的选择将会对检测体液中其它类型的DNA产生影响。

原文标题:

Enhanced detection of circulating tumor DNA by fragment size analysis

http://stm.sciencemag.org/content/10/466/eaat4921





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