NEJM:外显子组测序有助于慢性肾病的诊断

【字体: 时间:2018年12月29日 来源:生物通

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  近日,美国哥伦比亚大学的肾脏科主任Ali Gharavi领导的研究团队在《新英格兰医学杂志》上发表文章称,外显子组测序有望诊断出相当一部分的慢性肾病病例。

  

外显子组测序在某些临床领域正成为新兴的一线诊断方法,但对于大多数成人疾病,它在诊断上的作用尚未得到验证。这其中就包括慢性肾病。据统计,全球每十个人中就有一个受到慢性肾病的困扰。

近日,美国哥伦比亚大学的肾脏科主任Ali Gharavi领导的研究团队在《新英格兰医学杂志》上发表文章称,外显子组测序有望诊断出相当一部分的慢性肾病病例。

“我们的研究结果支持了外显子组测序在不同类别的肾脏疾病中的诊断作用,并强调了基因检测有望指导患者参与相关的临床试验和靶向治疗,这也鼓励了其他各科开展类似研究,”作者在文中写道。

研究人员对两个队列开展外显子组测序,总共覆盖了3,300多名慢性肾病患者。结合他们的诊断分析,外显子组测序在307名患者(9.3%)中发现了有诊断意义的变异。其中,一名不幸的患者携带了与39种单基因疾病相关的改变。

研究团队从这些患者中检测到66种单基因疾病,从先天性肾病到“不明原因的肾病”。在这些患者中,2,187名患者在哥伦比亚大学医学中心接受治疗,并能够提供家族史及其他临床信息。分析发现其中34名患者(1.6%)带有医学上可行动的变异。

“对于几名患者,我们通过DNA检测获得的信息改变了我们的临床策略,因为每一种基因诊断都有其自身的潜在并发症,在选择疗法时必须认真考虑,”Gharavi教授谈道。

研究人员解释说,目前的研究表明,外显子组测序的诊断率往往随着临床疾病和对象而波动,这促使人们去分析各种慢性肾病的外显子组序列。

“慢性肾病存在多种遗传原因,而治疗方法因病而异,”Gharavi说。“不过许多遗传类型比较少见,传统方法很难检测到。”

考虑到这一点,Gharavi和他的同事就对3,315名患有慢性肾病的个体开展分析。他们利用Roche或Integrated DNA Technologies的试剂盒来捕获蛋白编码序列,然后用Illumina的仪器进行测序。其中,281个病例之前被分类到“不明原因的肾病”。

在此次的分析中,307名患者在外显子组序列数据的帮助下获得了诊断。研究人员共发现206例常染色体显性疾病、42例常染色体隐性疾病、54例X连锁疾病以及5例多个分子诊断结果的病例。

对于之前被分类到“不明原因肾病”的281个病例,外显子组序列数据使得48个病例获得了分子诊断结果。诊断率达到17.1%。

“我们的结果表明,基因检测可用于肾脏疾病的个性化诊断和管理。肾脏科医生应当考虑将其纳入这些患者的诊断检查中,”Gharavi说。(生物通 薄荷)

原文检索:

Diagnostic Utility of Exome Sequencing for Kidney Disease

December 26, 2018
DOI: 10.1056/NEJMoa1806891

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