《Cell》新方式搜寻RNA-蛋白质网络

细胞中所有RNA分子都需要与蛋白质结为伙伴关系。德国癌症研究中心（DKFZ）的科学家和来自欧洲分子生物学实验室（EMBL）的同事研发了一种新方法，来分析细胞内完整RNA-蛋白质网络组成，这种新方法已发表在《Cell》杂志。

　　

RNA分子有许多关键作用：信使RNA（mRNA）帮助储存在DNA中的遗传信息翻译成蛋白质，人类细胞中mRNA约占RNA总数的5%；其他RNA分子不会被翻译成蛋白质，很多必须与蛋白质相互作用，不同类型的RNA与特定蛋白质形成高度复杂的分子机器，比如核糖体。

“RNA和蛋白质相互作用形成一个巨大的网络，但我们对这个网络的确切组成还知之甚少，我们想要了解哪些蛋白质与RNA结合，不同细胞类型或应激条件，这个网络的表现有何不同，现在，我们已经有了一种方法，使我们能够首次研究这些问题，”DKFZ的Jeroen Krijgsveld说。

目前为止，针对蛋白质RNA相互作用的方法只能分析mRNAs，其他非编码RNA（包括近两年新发现的很多品种）与蛋白质的相互作用无法利用现有方法检测。然而，非编码RNAs的数量远超mRNAs，它们的用途也相当广泛。

这种分析所有类型RNA与细胞蛋白质相互作用的新工具名为XRNAX，利用它，科学家鉴定了数百种以前不知道的RNA结合蛋白，而且不仅能看到什么蛋白与RNA结合，还能看到它们的结合程度。文章还描述了当细胞暴露于毒素时的RNA结合变化。

“利用XRNAX，我们能够测量蛋白质与RNA之间的所有相互作用，这是以前没人能够测量的，”新方法的研发者Jakob Trendel说。“蛋白质-RNA相互作用疑似与多种疾病有关，包括癌症、肌萎缩性侧索硬化症以及HIV等病毒感染。现在我们有方法好好观察它们了。”

Magna Nuclear RIP™Kit — 非编码RNA（lncRNA、enhancer RNA 、miRNA等）与蛋白相互作用创新技术

原文检索：The Human RNA-Binding Proteome and Its Dynamics during Translational Arrest

（生物通：伍松）