赛默飞推出一款广泛的微生物组检测芯片

【字体: 时间:2018年02月12日 来源:生物通

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  赛默飞世尔科技公司近日宣布推出一款微生物组芯片Applied Biosystems Axiom Microbiome Array,能够同时检测人类和非人类样本中的古细菌、细菌、真菌、病毒以及原生动物。

生物通报道  赛默飞世尔科技公司近日宣布推出一款微生物组芯片Applied Biosystems Axiom Microbiome Array,能够同时检测人类和非人类样本中的古细菌、细菌、真菌、病毒以及原生动物。

与美国劳伦斯利弗莫尔国家实验室(Lawrence Livermore National Laboratory,LLNL)合作开发,此款芯片能够加深对微生物的了解,同时促进人们将这些见解转化到人类健康和农业方面的应用。

随着新一代测序技术的价格不断下降,微生物组研究目前正在蓬勃开展,催生了大量微生物组数据,需要先进的信息学技术来分析。随着Axiom Microbiome Array的发布,人们可以采用正交的方法来阐明不同的微生物群。

此芯片的主要优势在于,它集合了NCBI数据库中12,000多个物种的序列,能够同时检测细菌、古细菌、真菌、病毒和原生动物,并实现轻松的分析。这种能力是传统的16S平台以及其他平台所不具备的。

在正式推出之前,Axiom Microbiome Array曾被英国生物样本库(UK Biobank)计划试用。此计划的实验室科学总监Rachael Almond博士表示:“Axiom Microbiome Array为我们采集的样本提供了有用的数据。”

“芯片结果提供了丰富的信息,有助于我们选择合适的样本采集方案。对我们的计划来说,此芯片的一大好处是能够简化分析,并同时拷问生物学的五界,”Almond博士谈道。

不久前,Axiom Microbiome Array还获得了“R&D 100大奖”。评委表示,这是首款高通量的泛微生物检测设备。它能够以DNA测序无法达到的价格和通量,来分析临床、环境或商业产品中的复杂物种,为健康和安全筛查带来新的机会。

这种广泛的微生物检测技术有望应用在多个方面,包括从各种临床样本和各种组织中发现已知和可疑的病原体。环境方面的分析则包括空气、土壤和水样,以及宇航员从太空环境和国际空间站上采集的样本。

赛默飞基因分型芯片平台的总监Shantanu Kaushikkar表示:“我们很荣幸能与LLNL合作,开发这款芯片和分析软件,为鉴定数千个物种提供了一种经济高效的技术。此解决方案有助于应对人类微生物组检测中的挑战。我们期待与全球的科学家合作,在人类和动物的微生物组研究上有所突破。”(生物通 薄荷)

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